提高電算化會計人員素質、重視內部審計等是加強電算化會計內部控制的關鍵與手工核算相比，會計電算化內部控制的形式、內容、內部稽核機制、重點等都發生了改變，給工作帶來一定的挑戰。
石景山區電算化會計內部控制出現的新問題就包括電算化系統下的會計及電算化崗位的職能權限問題；會計電算化導致單位自身內部稽核功能弱化；原始憑證數字化，交易處理痕跡不易被發現；會計電算化系統下差錯的重復性和蔓延性；會計軟件的安全性及保密性問題；會計資料的備份和保管不及時。
針對這些問題，筆者建議，強化安全措施，建立健全內控管理制度，嚴把系統安全關，加強信息系統操作人員的管理和控制，加強信息系統運行過程的管理和控制，加強信息系統的日常維護和信息檔案的保管工作，加強對會計信息系統的內部稽核和內部審計。
