第一，法院執行款在管理過程中存在的問題。一是管理模式落后，不適應現階段財政職能改革。最高人民法院在2006年做出《關于執行款物管理工作的規定》，規定的實施極大地推動了執行款的管理水平，但隨著我國財政體制的不斷改革與完善，特別是國庫集中收付制度的廣泛實施，其存在的弊端也顯露出來。一方面，專用賬戶設置不合法，根據國庫集中收付制度規定，行政單位只在銀行保留國庫單一賬戶，其他賬戶必須清理撤銷，在源頭上就否定了該做法；另一方面，統一專戶管理的票據使用不合理，眾多基層法院沒有統一的做法，有的單位無論收支均使用自制的票據，違背了會計核算中的清晰性原則。二是缺失監管，導致財政性資金流失。債權人沒有及時得到合法的經濟利益，使當事人的權益得不到保障，其主要原因是法院內部自行管理，缺少外部監督機制。由于申請人因有求于執行法官，即使明知對方當事人已履行或部分履行，也不便向執行人員催要。有些案件執行難度較高，往往需要多次執行，經過幾年的時間才能執結，而申請人經多次催要未果后逐漸失去信心，特別是小標的案件。以上原因導致大量執行款滯留在法院，案件所產生的利息本應歸屬地方財政，但由于資金的體外循環，導致該部分資金極易流失。
第二，法院執行款管理新模式的建議。一是加快法制建設，建立和完善執行款管理法規體系。參照預算外資金往來款的管理思路，在總結以往經驗的實踐基礎上，綜合協調法院和金融等單位，結合最高法院對執行標的款物的管理總體要求，應盡快出臺《法院執行款管理辦法》。二是將執行款納入預算外資金往來款管理，接受財政監督。執行款雖然不屬于財政性資金，但為確保執行款的收繳、管理和劃付安全，將其納入財政監管有利無弊。應深化收支兩條線管理，全面推行以收繳分離為主的改革，取消執行款專用賬戶，各地實行執繳分離。在此環節中，財政部門應控制執行款的收支活動。按照“先納入，后規范”的原則，加強事中的監管力度。三是規范票據在執行款收支環節的使用。財政部門應實行票據統管。建立一套科學的非稅收入票據體系，重點研制出適合當事人領款的專用兌付憑證。嚴格管理票據的印制、購領、使用、核銷及監管各環節，力求從源頭控制執行款的發展狀態。四是及時清理滯留執行款，防止國有資產流失。被滯留的執行款得不到兌付，不僅對案件當事人不公正，而且會提高單位的審計風險。對于確定無法支付的執行款，及執行款在銀行產生的利息應及時上繳國庫，納入財政預算管理。五是創立電子化管理執行款服務平臺。結合財政管理信息化建設，研制執行款計算機軟件管理系統，提高資金運作的透明度，利于及時將執行款退還當事人，便于廣泛的群眾監督。同時擺脫舊的會計核算模式。全面、清晰地反映執行款的進度及明細。六是加強內、外部審計，促進管理上水平。在開展內部系統審計時，應以執行款資金安全為重點，從繳款、核撥、支付到賬務核算，按照適度分權的原則。嚴格審批付款制度。同時引入當事人監督機制。
