2002年起，財政部按照各部門支出的不同性質，將部門預算明確區分為基本支出和項目支出，采取不同的預算編制方法，并相應制定了《中央本級基本支出預算管理辦法》和《中央本級項目支出預算管理辦法》等一系列預算管理制度。
近年來，在借鑒西方市場經濟國家成功經驗的基礎上我國努力推行以部門預算、政府采購和國庫集中支付制度為核心的公共預算改革。在構建新預算模式的三項核心制度中，部門預算是關鍵，推進以部門預算管理制度改革為核心的公共財政支出改革是建立和完善社會主義市場經濟體制的客觀要求，是轉變政府職能、規范財政管理的現實選擇。
一、當前部門預算的編制和執行存在以下幾個方面的問題
（一）部門預算的編制、批復與執行時間在銜接上存在空檔，影響了執行力度
我國的國家預算是采用各級政府提出預算草案，報同級人代會審議批準并監督其執行的方式，這在本質上大大強化了其計劃性而弱化了其法律性和政治性。從形式上看，部門預算實行“兩上兩下”的編報程序。目前,“一上”基本能做到由下至上逐級匯總上報, 但當財政部門將“一下”控制數下達到各部門后, 各部門編報正式預算的時間非常短, 很難做到從基層單位逐級匯總預算。從基層單位開始編報預算, 是保證部門預算完整、真實、科學的基礎, 是增強基層單位預算管理, 完善國庫集中支付制度和政府采購制度的必要前提。預算管理每年的1月1日已開始進入預算的執行期，但一直要到執行預算當年的全國人大開會批準之后預算文件才能取得法律上的效力，當年的1-3月間形成一個“空窗期”，這意味著各部門每年要有一個季度甚至小半年的時間處于無預算狀態，存在預算先期執行的問題。這種不規范的先期執行的做法弱化了預算的法律約束力，容易在制度上造成上年同期的不合理支出變成合法化，給本年部門預算執行留下隱患。
（二）批復的部門預算不能完全滿足實際需求，預算項目的調整報批方面存在一定的隨意性
在預算編制過程中, 由于時間和傳統做法的影響,財政部門和業務部門之間、部門上下級之間缺乏有效溝通, 對實際需求了解不夠。財政部門或上級主管單位的財務部門在核定預算時, 缺乏客觀依據, 該安排的項目沒有安排, 不該安排的項目安排了, 或者對所報項目的預算金額統統削減一部分, 這些做法都會對預算的科學性、合理性造成一定的影響。部分單位支出不按預算走，亂支亂用，造成基本支出超支嚴重，挪用、擠占項目資金，以此來彌補基本支出不足；而一些項目支出由于項目未落實或資金被挪用，造成項目結余過大，從而導致預算支出完成情況與預算編制目標存在很大差異，財政資金使用效益未能完全顯現。
（三）缺乏科學有效的部門預算編制的監督和績效評價機制
財政支出的績效評價是財政延伸管理和后續管理的重要內容，是提高支出效益、規范支出行為的重要手段。建立績效評價機制應貫徹成本--效益的原則和經濟效益與社會效益相統一的原則。盡管目前財政部制定了一些具體財政支出領域的績效評價方法，但在實際工作中，部門預算特別是項目支出預算尚沒有建立有效的績效評價、追蹤問效機制。在預算具體編制過程中，由于項目之間缺乏可比性，難以做到按輕重緩急排列次序。各級財政部門和行政單位在項目預算績效管理方面普遍缺乏經驗，尚未形成一套行之有效的績效管理方法，仍存在著各部門爭著上項目、多立項多要錢的現象，而對最終的績效接管卻缺乏相應的考核，這就大大降低了財政資金的使用效益。
二、針對以上情況，我們對于強化部門預算管理提出下面幾點建議：
（一）合理安排部門預算的編制時間，保證執行效力
目前，人民代表大會的預算審批時間已經提前到2月份左右, 假如仍把公歷年度設定為預算開支年度, 那么更合理的做法應該是把本年預算編制和審批批復在上年末完成，盡量做到預算編制、審批和預算執行的無縫銜接，從而保證每筆財政支出都可以按預算支出，進一步降低支出的隨意性。
（二）制定科學的部門預算編制定額標準體系，規范預算項目調整的報批手續
隨著預算編制啟動時間的提前, 預算編制周期的拉長,各級財政部門和單位應把大量的精力和時間用于進行宏觀形勢的預測、年度工作計劃的制定以及業務管理部門和財政管理部門之間反復磋商上。這樣, 預算編制經過有關各方面的充分研究分析和醞釀, 才能比較好地把實際需求和財政支持結合起來。財政部門應認真研究，完善部門預算編制的程序和方法，科學合理地制定定額標準，進一步細化預算編制，既要統籌兼顧各部門的主要工作職能、年度目標和任務，又要通過準確合理的預算給予這些部門實現職能任務的財力保障。只有切合實際的預算才能增強執行力度，才能起到指導和約束實際收支行為，達到預算目標的作用。預算一經確定就必須嚴格執行，不得隨意調整和追加。實際執行中確實需要調整的，必須按規定程序報批。未經批準，不得調整預算。必須徹底改變“預算粗粗算、追加報告滿天飛、專項結轉過多”的弊端，有效防止預算項目被擠占、挪用，以維護預算的嚴肅性。
（三）完善財政支出績效評價、項目績效評審機制
按照各類支出的性質和目的定期或專項考核。如對公共工程投資效益的評價，應側重對其經濟效益和產出的考核；對經費性支出的考核，應側重社會效益和管理效率的綜合考核；對某些專項支出的考核，可以把經濟效益與社會效益的考核結合起來進行，穩步推進項目支出預算績效評價試點工作，進一步提高財政資金的有效性。并將績效考評結果作為以后年度項目支出預算安排的重要依據。
由于項目評審的結果會直接影響到預算資金在不同部門和單位之間的分配，關系到國家宏觀調控政策的具體實施。因此，應本著對項目評審公開、公平、公正，但又不偏離國家宏觀調控政策的原則，建立科學的、行之有效的項目績效評審機制，根據當年項目輕重緩急進行合理排序，并對預算執行過程中的資金使用情況、項目的效益情況實行追蹤問效制度，以及時采取措施堵塞各種管理漏洞，確保財政資金發揮最大的效益。
（四）進一步建立健全部門預算追蹤問效制度、預算執行的監督制度
建立健全部門預算管理監督制度，加強對預算執行情況進行檢查，避免“只管支付，不管使用”的情況出現，應重點放在項目資金及專款使用方面，這些資金在使用上是合理高效還是隨意浪費，對這些資金是管理有方還是管理混亂，有無重大違法違紀問題等。要加大查處規范力度，建立預算執行監督的長效機制，實現對部門預算資金運行和管理的全方位、全過程監督，增強預算的約束力，維護預算執行的嚴肅性，提高預算執行效果和財政資金使用效益。今后的預算越來越強調嚴肅性。由于部門預算的透明度增大了, 并且是按《預算法》規定的程序編制, 經過國家最高權力機關批準實施的, 是具有法律效力的。因此, 預算的執行, 應達到市場經濟國家所要求的那樣，金額不多不少、時間不遲不早，嚴格按照預算規定的數量和進度執行。有法律效力的預算文件一經立法機關通過以后, 執行上必須一絲不茍。
另外, 從編制預算的視野上來看, 為了社會事業的發展能在預算上得到比較好的銜接, 今后應考慮借鑒市場經濟國家的經驗, 按照標準周期實行預算的總共編制。美國的聯邦預算是按照五年的總共編制, 一次編五年, 然后逐年向前滾動編制。這樣編制預算視野就始終保持在五年的基礎上。因為大部分項目不是發生在一年或一年就可以完成的, 因此, 從科學管理的要求來看, 視野太短不便銜接前后項目, 科學管理要求有這樣的滾動。
