長期以來，根據《事業單位財務規則》和《事業單位會計準則》的有關規定，高校的基建投資核算和教學科研業務核算分別執行《國有建設單位會計制度》和《高等學校會計制度》并分別設置不同的賬務核算體系，導致其中的任何一套賬務都不能全面、完整、準確地反映高校的財務狀況和收入支出情況，只是反映了高校經濟活動的一個方面，違背了會計制度要求會計核算反映會計主體全部經濟活動的基本前提。因此，高校基建賬與經費賬合并就尤為必要。
高校基建賬與經費賬合并，將高校由原來的兩個會計主體合二為一，增強了高校會計核算的科學性，有利于全面反映高校的財務狀況，有利于提高高校的財務管理能力。
高校基建賬和經費賬的合并，為高校財務會計取消重復核算，人為拆分基建項目，建立一套綜合反映高校整體經濟業務活動的綜合賬務體系以及消除高校財務管理活動方面的諸多困惑提供了解決的平臺。基建賬和經費賬的合并，意味著要由一套賬務記錄、核算和反映原來由兩套賬務分別記錄、核算和反映的經濟事項，能夠比較全面地反映一所高校整體的經濟業務活動，符合會計制度對會計核算的基本要求，增強了高校會計核算的科學性，有利于全面反映高校的財務狀況，有利于提高高校的財務管理能力。
高校基建賬與經費賬的合并，可以解決原來由于預算管理體制和撥款渠道不同導致同一筆資金在兩套賬務中重復核算的問題。
高校基建賬與經費賬的合并，可以把原來在兩套賬務中獨立反映的經濟事項集中到一套賬務中綜合反映，避免了同一筆資金在兩套賬務中重復核算的問題，不但能夠降低核算成本，而且能將過去游離于經費賬之外的因高校招生規模不斷擴大，基建投資規模迅猛增長而主要依靠銀行貸款的基建投資借款如實反映到學校綜合賬務中，以適應財政預算管理體制改革和實行綜合部門預算的要求，將預算單位的所有收支統一納入到綜合預算編制中，方便預算單位對各類資金的統籌安排。
基建賬與經費賬的合并，有利于全面、準確、真實地提供財務信息，為多元的投資主體和學校決策層的投資決策提供數據支撐。
基建賬與經費賬分設的情況下，高校的銀行貸款基本都在基建賬中反映，大量的貸款利息支付也在基建賬中反映，相應地基建報表和部門決算報表（經費報表）所反映的經濟內容也各不相同。受到重視的部門決算報表主要反映的是教學科研業務活動方面的經費收支情況，對基建投資方面的信息反映不全甚至極少反映，而基建報表雖然包含了基建投資方面的大量信息，但沒有引起高校領導和主管部門的足夠重視，有可能對高學校的決策層產生錯誤導向。而基建賬與經費賬的合并可以有效地克服上述問題，比較全面地反映學校資產、負債和收支全貌，為避免高校負債狀況不實盲目擴大投資提供了足夠的財務信息，同時也為金融機構評價高校的財務狀況提供了詳細資料，為多元的投資主體和學校決策層的投資決策提供了數據支撐。
高校基建賬與經費合并具有可行性。一是高校財務人員綜合素質的不斷提高，會計信息化的進一步普及和行業整體財務管理水平的提升，為高校基建賬與經費賬的合并提供了條件。二是《國有建設單位會計制度》與《高等學校會計制度》有著相同的會計核算基礎——收付實現制，在會計核算方法與財務處理程序方面也有許多相同或相似的地方，為高校基建賬與經費賬的合并提供了支點。三是目前一些成熟的工業企業實現了基本建設財務會計與企業財務會計并軌，為高校基建賬與經費賬的合并提供了借鑒模板。四是基本建設會計制度與行政事業單位會計制度并軌是市場經濟發展的必然，也是會計國際化的發展趨勢，更是預算會計國際協調的需要，他們共同為高校基建賬與經費賬的合并奠定了基礎。(作者單位：榆林學院）
