隨著計算機的普及，財務會計軟件的日趨成熟，越來越多的單位采用計算機及會計核算軟件進行賬務核算、報表生成與匯總、財務分析等財會工作，替代傳統的手工記賬方式。與傳統的手工記賬方式相比，利用信息化會計，總賬、明細賬自動登錄，可以自動進行試算平衡、對賬、結賬，會計報表可以自動生成與匯總，會計數據處理的速度加快了，會計核算的準確性和可靠性得到了極大的提高，減少了因疏忽大意及計算失誤造成的差錯，使日常枯燥的會計核算工作量大大減輕，還能利用會計核算提供的數據和其他經濟數據，借助計算機會計管理軟件的功能，幫助會計人員合理地籌措資金，運用資金，控制成本開支、編制財務計劃，進行財務分析，為公司的決策提供依據等。由于所有數據都以二進制方式存儲在計算機環境中，改變了傳統的紙質方式，在會計數據處理流程，處理方式，內部控制方式及組織機構等方面都與手工處理有許多不同之處，使傳統的會計控制方式遇到了挑戰，也為公司的內部控制帶來了許多前所未有的新問題，對公司內部控制制度造成了極大的沖擊，由于會計信息系統的特殊性，建立一整套適合信息化會計信息系統的內部控制制度就顯得尤為重要。
一、會計信息化與傳統手工會計的比較分析
(1)在手工記賬方式下，一切的經濟活動都記錄在不同的紙質文件上，有據可查，具有較好的直觀性，財務人員各自在自己的權力與責任范圍內制作記賬憑證，登記會計賬簿，編制會計報表，并在上面簽字或簽章，有利于核對，相互制約，責任分明。這種原件上的數據如果被人修改，容易留下能辨別的痕跡。在會計信息化環境下，記賬憑證是登記賬簿的依據，電子賬簿的準確與完整完全依賴于記賬憑證，因而使用者要確保記賬憑證輸入的準確、完整，雖然最終也會輸出機制的會計憑證，賬簿與報表，但這一切都取決于存儲在計算機磁性介質上的數據，這些數據是無形的，改動時也基本不留痕跡，要安全地保存這些數據也與保存紙質文件有一些不同。
(2)在手工記賬方式下，憑證要經相應部門審核簽章后才能登記入賬，財務部門經過長期的探索，實踐，總結，建立了一整套內部會計控制制度，各會計人員做到權責分明、相互制約、相互監督以確保會計數據資料真實、完整，保護單位資產的安全、完整和確保國家有關法律法規和單位內部規章制度的貫徹執行。會計
核算的質量取決于會計人員的業務水平、工作態度以及對會計有關法律法規和規章制度的貫徹執行效果。實行信息化會計后，記賬憑證經操作員制單錄入、審核后，就可以由于軟件自動生成總賬，明細賬，日記賬，余額表等多種標準賬表，并可以打印出來，在未輸出之前，也是保存在電腦中，使會計資料的書面形式減少，并帶來新的簽字、審核、記賬方式問題。采用信息化后，除軟件可自動有一定的校對、審核功能外，出納簽字，主管簽字，審核員審核憑證都在電腦上完成，以確保記賬憑證與原始憑證相符，會計分錄的正確。這使得部份手工記賬方式下的內部控制制度在實行信息化后沒有存在的必要，如不需要平行登記賬簿來防止差錯；不需手工編制科目匯總表，不需核對總賬和明細賬；人員的授權方式與崗位的設置也有了新的變化。
(3)會計信息化帶來了新的安全問題，由于數據存儲在電腦中，數據易于被未經授權的人員瀏覽，復制，系統在聯網環境中易于被入侵，系統也可能被人有意無意地修改和刪除而不易察覺，這都給數據的安全完整構成了嚴重的威脅，給有不良企圖的人員利用計算機進行貪污、舞弊等違法犯罪行為提供了方便，從而可能給單位帶來不可估量的損失。
二、加強會計信息系統內部控制的途徑
(一)建立健全相應的信息化會計崗位責任制度
1、領導要重視
單位領導應當根據公司的實際情況和會計業務的需要，結合信息化工作的特點，按不相容職務相互分離的原則，合理設置會計及相關工作崗位，明確職責權限，形成相互制衡機制，防止和減少舞弊行為的發生，保證會計資料合法、真實、準確、完整。加強公司監督，建立健全合理的內部控制制度，關鍵在領導，而且《會計法》規定單位負責人要對本單位的會計工作和會計資料的真實性、完整性負責，所以領導必須重視內部控制制度的建立。
2、會計信息化崗位的設置
一般地，會計信息化后的工作崗位可分為基本會計崗位和信息化會計崗位。基本會計崗位包括：會計主管、出納、會計核算、會計稽核、會計檔案管理等工作崗位。信息化會計崗位一般可分為：系統管理員、賬套主管（可由系統管理員兼）、操作員、審核記賬員、系統維護員，會計檔案資料保管員等。
系統管理員負責協調計算機及會計軟件系統的運行工作，可以建立、刪除賬套、設置數據備份計劃，添加用戶并合理設置用戶權限、操作上機日志并負責信息化系統的日常管理工作，保障系統的正常運行；賬套主管則可以建立、刪除年度賬，修改賬套和具有可對整套賬的操作權限；操作員負責輸入記賬憑證和原始憑證等會計數據，打印記賬憑證、會計賬簿、報表和進行部分會計數據處理工作；審核記賬員負責對輸入計算機的會計數據（記賬憑證和原始憑證等）進行審核，操作會計軟件登記機內賬簿，對打印輸出的賬簿、報表進行確認，防止利用計算機進行舞弊；系統維護員負責保證計算機硬件、軟件的正常運行，管理機內會計數據；會計檔
案資料員崗位主要是根據《會計檔案管理辦法》對會計憑證、會計賬簿和財務報告等會計核算專業材料以及各類數據磁盤、光盤的收集、保管、查閱、保密等工作。
3、注意事項
在日常操作管理過程中，系統管理員應根據電算人員的職責和權限設置用戶并分配適當的權限；憑證的簽字、審核、查詢、打印以及賬簿的打印權限應合理分配給用戶，非出納人員不能授予出納權限；基礎選項設置項只能看不能修改，并督促他們設置用戶密碼并經常更改、不得泄漏，各操作人員只能在賦予的權限內操作系統，不得越權，不允許修改、作廢他人填制的憑證，出納憑證必須由出納簽字，所有憑證需經主管會計簽字后才能記賬。權限分配細化，使執行的每項經濟業務都有適當的授權和不相容職務分離控制，賦予一部份人員輸入憑證，一部份人員審核憑證，一部份人可查看憑證，一部份人可打印憑證，以確保輸入記賬憑證正確，財務數據不被非授權人員查看。及時查看上機日志，定期備份日志并存檔。所有的信息化操作人員都應當經會計信息化培訓，并取得財政部門頒發的會計信息化合格證，同時加強職業道德教育，提高政治素質，強化責任心。基本會計崗位和信息化會計崗位，可在保證會計數據安全的前提下交叉設置，各崗位人員要保持相對穩定。
