醫院內部管理體制以及外部政治環境的影響使其醫院的經營狀況發生了翻天覆地的變化，為此醫院的經濟范疇也在不斷的發生變化。新醫院會計制度的改革，這對醫院財務核算管理有著深遠的影響。新的醫院會計體制改革將對新醫院會計體制順利開展有著深遠的意義，新醫院會計體制改革成為當前討論的重點，如何將醫院財務核算做好，把握醫院財務會計信息的準確度以及會計信息的透明度，才能將醫院財務會計體制做好，發展醫院整體經營理念。
一、新《醫院會計制度》執行的必要性分析
打破傳統醫療會計制度體系，只有發展新的醫院會計制度改革才能適應我國衛生部門的要求，適應國家醫療機構的要求，不斷的完善自身醫療體系缺陷。
在這種新的醫療體系改革的背景下，醫院會計制度新體系重點要對成本核算進行分析。這種新的醫院會計體系建立在國家衛生機構下的順應老百姓及國家政府需要的重大轉變。其主要是要加強財政對其醫療的支持情況，建立公益性的醫療衛生體系，將最基本的醫療衛生體系對外開放，解決老百姓看病難的特點，讓老百姓享有最基本的醫療服務。在新的醫療會計體系執行之前，事實上，醫院財務信息不能真實的得到反饋，且不具備信息的可靠真實度，之前部分醫院高級管理層人員為了“做好”報表，甚至不惜一切縱使相關會計人員在成本費用上“動手腳”，暗地調控收支結余，在報表上變為帳面反映為盈利而實際已發生虧損或者帳面上顯示虧損實際上是盈利的狀況，這種狀況將使醫院走下坡路線，對醫院的發展及其不利，帶來的只有失敗。
二、新舊醫院會計制度核算差異的探討
(一)如何進行藥品
在舊的會計醫療體系下，醫院藥品的核算方法主要還是采用售價的方式，當醫院工作人員對藥品進行檢驗并且驗收的時候按照的是售價進行核算，核算方式是借記“藥品”， 貸記“銀行存款”按照進價進行核算的，貸記“藥品進銷差價”就按照其進價和售價的差額進行核算記賬。在藥品辦理入庫時，即要按雙價計量，同時在藥品管理系統中錄入藥品進價和銷售價，藥品進銷差價為兩者差，藥品的出庫、零售、領用全部按銷售價結轉，期末，會計按比例確定應結轉的藥品進銷差價。
在新的會計改革體系下，醫院以實際成本形式核算藥品價格，醫院在購進藥品時，將其藥品的實際成本計價，“庫存物資(藥品)”為借記，“
銀行存款”、“應付賬款” 為貸記，如果采購的藥品時國家補助、科教性質的資金，將“待沖基金”科目作為貸記。故醫院在銷售其藥品的時候就要按照藥品的實際銷售價格收入，與此同時將銷售出的藥品實際成本轉化為藥品的成本，采購的藥品使用國家補助、科教性質的資金購入的藥品就要按照賣出藥品相之對應的待沖基金金額來沖減待沖基金。
新老會計體制總，藥品核算存在很大的差別。首先，舊體制改革下的分別核算中醫藥，一級科目是將醫療收人”、 “醫療支出”和“藥品支出” “藥品收入”、并列開來的，在新的會計體制改革中醫療收入和支出中核算體現的是藥品的收入和支出，其醫療理念大大的得到了滿足。其二，新的醫療會計體制與舊的醫療會計制度的計價方式也是不一樣的，新的醫療會計體制將醫院資產的實際價值一目了然。其三，新的醫療會計體制下，其藥品成本結轉方面表現的時間也是不一樣的，舊的醫療會計制度在月末才會結轉藥品成本，新的醫療會計體制下在進行藥品銷售的時候，藥品收入的確認與結轉藥品的成本是同時收入的，達成收入與支出相結合的原則。
(二)關于成本核算
新舊會計體制中的成本核算有所不同，老的會計體制中淺略的談到了成本核算而在新的會計體制下強調了成本核算管理制度，從而使其醫院成本信息更加明確、透明且反饋的及時，大大的減少了醫療成本核算，提高了成本意識，增強了醫院績效管理體制。其一，更加的明確了成本核算的對象原則，應該遵循其分期核算、可靠性、合法性、相關性、權責發生制、收支配比、按實際成本計價、一致性、重要性的成本核算體系，將診次、科室成本核算、醫療服務項目成本核算、病種成本核算、病種成本核算作為成本核算的對象。第二，所以無論在成本核算還是會計科目的設置上都適應了成本核算的要求。此外，提取醫療風險基金、固定資產折舊費、衛生材料費、無形資產攤銷費、無形資產攤銷費、人員經費、藥品費等作為一級醫療明細科目將其放入醫療業務成本目錄下按其醫療輔助類、臨床服務類、醫療技術類、等各個科室進行明細直接成本的核算。例如，材料屬性、品種或者藥品在加工物資(自制物資)的明細科目中體現，放在自制物資成本中，按照間接費用、直接材料、其他直接費用、直接人工分別進行成本核算。三是在進行各個科室之間的成本結轉以及劃分更加的透明化、原則化，科室類是由臨床服務類、醫療輔助類、行政后勤類以及醫療技術類組成的。臨床服務類、醫療技術類、醫療技術類和醫療輔助類包括在行政后勤類科室的管理費中，其醫療輔助類科室成本包含醫療技術類科室和醫療技術類科室，最后醫療技術類科室成本在臨床服務類科室中體現出來。
(三)如何核算固定資產
在舊的會計體制下，專業設備單位價值在800元以上，單位價值在500元以上并且使用年限在一年以上的，其使用過程中基本保持原有物質形態的資產都屬于固定資產。核算的范圍很廣，大大的加強了固定資產核算工作量。雖然單位價值還沒有達到規定的范疇，但是在使用壽命達到一年以上的大批同類物資都會作為固定資產的有效管理，根據其經濟途徑和使用狀況,醫院固定資產由以下五類情況組成：一般性設備；建筑物、房屋；專屬設備（專用設備）圖書；其他的固定資產組成的，不計提其中的折舊費，在提取一定比例的修購基金按其固定資產本身的面值計提。
