一、事業單位內部會計管理存在的具體問題
(一)事業單位對會計工作重視不夠
在事業單位，會計工作一般不是單位的中心工作，大多把會計工作列為“后勤”，財務管理松弛，用人不當，有的單位任用不熟悉會計業務的人員從事重要的會計崗位，導致會計業務流程不暢，賬目混亂；對會計人員沒有明確的考核、獎懲制度，形成了干好干差一個樣，不能充分調動財會人員的工作積極性;事業單位會計人員地位很低，職稱聘任是個大難題，會計人員好不容易考取的專業技術職稱，由于事業單位沒有財會人員中級、高級指標遲遲難以聘任。
(二)會計人員崗位責任不明確
事業單位，有的會計人員不明確自己的崗位職責，不知道自己應該承擔哪些責任；有的會計人員把會計和出納的崗位職責混為一談，不能有效地實行牽制；有的甚至把不能分割的會計業務分給兩個人做，造成業務處理混亂，責任不明確。
(三)沒有明確的會計人員崗位輪換制度
會計人員崗位輪換是內部會計管理的一項重要制度。在事業單位，有的會計人員長期把守在會計崗位，沒有輪崗意識，日子久了，工作拖沓，對新的專業知識和會計制度淡薄，導致會計工作滑坡。
(四)內部牽制制度不健全
實際工作中，有的單位出納人員兼職保管或會計檔案管理工作；有的會計人員將支票和在銀行的預留印鑒全部集中在自己手中，只經會計人員一人之手就能把款項支付出去，這些做法都是嚴重錯誤的，不利于會計工作健康有序的運行。
(五)沒有健全的會計交接制度
有的單位會計人員工作變換時，新任會計人員已開始了新的業務，前任會計人員對原會計工作尚未履行移交手續。這樣，就會造成某些業務經濟責任不明確，嚴重破壞了正常的會計工作秩序。
(六)事業單位會計人員業務水平普遍較低
會計是一種專業性、政策性很強的工作。事業單位專業化的會計人員很少，大多是“半路出家”，會計專業理論基礎薄弱，對財經法規、會計制度不夠熟悉，賬務處理不夠規范，財務管理水平不高。
(七)事業單位內部財產物資管理制度不健全
有的單位在存貨、固定資產方面未設會計科目，有的會計科目設置了，但賬目不完整，帳實不符，不能全面準確的反映財產物資的真實情況，會計科目的設置沒有起到財務管理的作用；有的單位沒有設置專門的資產管理部門和資產管理員，會計賬目形同虛設，沒有實際意義。
(八)事業
單位會計機構缺乏內部稽核制度
事業單位應該在會計機構內部設立稽核崗位，對會計工作進行復核、檢查，及時糾正錯誤、偏差。事業單位配備的會計人員少，常常忽視了會計稽核工作，沒有設置稽核崗位。
二、如何加強事業單位內部會計管理制度建設
(一)建立內部會計管理體系
事業單位內部會計管理體系，主要是指一個單位的會計工作組織體系。事業單位應該在單位負責人領導下設置會計機構、配備會計人員，根據會計人員的業務能力進行分工,領導會計人員和其他人員認真執行會計法律，督促內部會計管理制度的貫徹實施。
(二)確立會計人員崗位責任制度
會計人員崗位責任制是單位內部會計人員管理的一項重要制度，定員定崗，明確分工，各司其職，作為會計人員，首先要明確自己的崗位職責。事業單位最基本的會計機構人員配備是會計主管人員和出納人員，其崗位職責是：
會計主管人員的崗位職責：熟悉財經法規，認真執行《會計法》及各項財務制度，組織本單位的會計工作，根據會計核算形式確立本單位的會計業務流程；依法設置會計賬簿，對本單位的經濟業務進行會計核算，切實做好會計基礎工作。
出納人員的崗位職責：熟悉《會計法》、《會計基礎工作規范》等各項財經法規，嚴格遵守、執行國家會計法律法規和會計制度。認真審核各項支出的原始憑證，對違反國家規定的開支，應拒絕付款，對內容不真實、不合法、手續不完備的報銷憑證，不予報銷。嚴格遵守現金管理制度，庫存現金不得超過定額,不坐支、不挪用現金。負責發放工資、各種獎金、津貼、補貼。負責保管空白支票和一枚在銀行的預留印鑒，做好支票的簽發工作，不得簽發空頭支票。加強安全防范意識和安全防范措施，妥善保管現金和各種有價證券。
(三)建立內部牽制制度
內部牽制制度，是指凡涉及款項和財物收付、結算及登記的任何一項工作，必須由兩人或兩人以上分工辦理，以起到相互制約作用的一種工作制度。
(四)建立財務收支審批制度
建立健全財務收支審批制度，是會計工作的關鍵環節。
首先，確定財務收支審批人員和審批權限。具體地說，應當明確單位負責人、總會計師（財務負責人）、其他有關部門負責人審批財務收支的范圍和最高限額。
第二、確定財務收支審批程序：
1、對于材料采購方面的支出
首先由倉庫保管員根據經辦人采購物品提供的原始憑證，按其品名、數量、金額驗收入庫，驗收完畢，開具材料入庫單并且在原始憑證上簽字；其次由相關部門負責人簽字證明此業務的真實性、合理性、實用性；送會計部門進行財務審核；由單位領導根據審批權限審批；最后交會計人員審核、處理。
2、對于差旅費方面的報銷
首先由出差人員根據差旅費報銷的有關規定填制差旅費報銷單，然后由相關部門負責人簽字證明其業務的真實性，
經會計部門進行財務審核后，由單位領導根據審批權限審批，最后交會計人員審核、處理。
(五)確立賬務處理程序制度
事業單位應根據國家統一的會計制度規定，確定本單位會計科目和明細科目的設置；根據國家統一的會計制度規定和單位會計核算的要求，確定本單位會計憑證格式、填制要求、傳遞程序等；確定本單位總賬、明細賬、日記賬的設置、格式、登記、對賬等要求；根據國家統一的會計制度規定按月編制會計報表。
(六)建立會計崗位輪換制度，保證會計工作質量
事業單位應當有計劃地實行會計輪崗制，每隔3-5年輪換一次。實行會計輪崗制度，有利于加強會計工作的內部監督，防止貪污腐化行為的出現；可以使會計人員熟悉不同崗位的業務內容，有利于調動會計人員的工作積極性和創造性，激發會計人員充分發揮其主觀能動性，不斷提出業務工作的新思路和新思想；通過崗位輪換，還可以發現各個崗位最適合的工作人選。
(七)健全會計交接制度，保證會計工作的連續性
事業單位會計人員工作變動、離職時，應當履行會計交接手續。進行會計手續移交時，必須將已受理尚未辦理完畢的經濟業務處理結束方可移交，對于遺留問題應寫出書面說明材料；編制移交清冊，按移交清冊所列項目逐項移交；一般會計人員移交時由會計主管人員負責監交，會計主管人員移交時由單位領導人負責監交。
(八)建立財產清查制度
事業單位應當建立財產清查制度，成立財產清查小組，每年至少清查一次。財產清查的范圍主要是現金、材料物資、固定資產；每年末了，財產清查小組成員對各項財產物資進行清查、盤點，并將盤存數和會計部門提供的帳面數核對，若帳實不符，應查明原因，出現財產短缺的情況，要落實責任，屬于財產管理人員的責任過失，要進行賠償。最后將盤存結果和處理意見交單位領導審核批準后送會計部門做賬務處理。
(九)提高財會人員素質，建立科學的會計人員考核、獎懲和聘任制度
提高會計人員素質，可以通過自學和培訓相結合。鼓勵會計人員參加會計專業學歷考試、會計職稱考試，不斷提高會計人員專業理論水平和實務操作能力；重視在職培訓，加強會計人員繼續教育，提高其業務素質；強化會計職業道德教育，提高會計人員思想道德素質。要充分調動財會人員的工作積極性，樹立以人為本，人盡其才的思想理念，對業務能力強，會計基礎工作做的扎實、規范、財務管理水平較高的會計人員，應給予物質與精神獎勵。事業單位會計人員在各單位所占比例很小，是一種弱勢群體，他們考取的會計職稱，都是有很大難度的，其技術職稱已經代表了他們的業務能力，在職稱聘任時應當給予鼓勵、支持，和單位其他專業技術人員的聘任同等對待，讓他們在希望中進取，在希望中不斷提高理財能力。
總之，在經濟迅猛發展、社會快速進步的今天，只有重視會計工作，尊重會計制度,才能促進經濟的發展。加強事業單位內部會計管理制度建設，是搞好會計工作的關鍵。只有在健全的內部會計管理制度指引下，才能規范會計行為，促使會計工作健康、有序地運行和發展；只有健全的內部會計管理制度,才能調動財會人員的工作積極性，激發他們的工作熱情，促使他們充分發揮主觀能動性，從而不斷提高財務管理水平，使事業單位有限的資金發揮最佳的使用效益。
