事業單位的財務管理對預算資金的控制是在其經營中控制的幾個層面、環節以及總體的目標統一的規劃和控制，是事業單位對預算資金的管理，和經營目標的重要組成部分和手段。資金是事業單位的血液，那么事業單位怎樣才能有效地對預算資金的使用進行管理和控制？使得單位有限的資金得到充分的利用，這已經已成為事業單位首先要解決的重要問題之一，也是財務管理的核心問題。
一、事業管理單位財務管理對預算資金的管理及控制的問題
(一)財務預算的實際作用被減弱
部分單位領導對財務預算資金控制在事業單位中的實際作用，重視與認識都不夠完全，沒有把財務預算資金的控制作為財務管理的內在環節認真處理好。財務管理職能較弱，資金使用效果比較低下，部門資金的預算很不規范，資金支出也沒有計劃性和定額，有的部門即使有計劃但定額也形同虛設。而且財務部門對資金的管理也并未經常核算，對于資金在使用前的預算和在使用中的控制更是不到位，對經費收支的考核也只是停留在表面工作，很少對資金的使用效率進行考核。因此，預算資金的使用及管理和控制都很低下。
(二)事業單位對資金預算管理制度不健全
事業單位對于資金預算管理在制度上并不健全，主要體現在：專項資金的管理，監督不嚴格，提供資金的使用范圍過于寬松。很多事業單位在撥發專用資金前，對項目缺乏必要的論證，使得資金和項目之間存在著嚴重脫節，這就導致事業單位在各級財務預算、決算中幾乎所有支出項目都有專項經費，使得預算資金的使用范圍帶有極大的模糊性和不確定性，資金分配缺乏完整、規范有序的財務預算程序。財務管理預算機制不夠健全，對其管理制度的不完善，項目管理人員編制的預算，常常對預算編制缺乏足夠的認識，及重視。編制預算簡單，審批不嚴格，模式缺乏規范化。
(三)預算資金管理及控制要求事業單位的組織機構一體化，緊密相連，管理的網絡化
同步進行互相銜接相互配合密切，預算的編制、審核以及檢查機構適應管理的內在需求，部分事業單位雖有預算管理部門，單位組織結構仍然是原有模式。在預算資金的管理及控制中，難免存在統一性的不足，使得事業單位對預算資金的管理和控制不具有科學性，可行性。以及預算的執行情況沒有得到檢查的嚴肅性。有的事業單位在項目支出資金管理中，基本只是有個項目但
是支出并不清楚，借用項目支出來彌補基本支出的不足，通過這種手段來用于日常公共的支出，并沒有做到專款專用，這就出現了重撥款和輕管理的現象，表面重預算但實際效果并不高，對項目資金實際使用缺乏有效地管理和控制。
我國事業單位傳統預算的體系是預算資金內外分離的預算體制，事業單位在編制預算時并不能充分考慮預算資金的收支具體情況，目前，隨著經濟體制改革的不斷深入，這也使得單獨考慮預算資金編制的財務預算逐漸失去其經濟意義，不能真實地反應事業單位的收支狀況和運營效率。
二、對事業單位的預算資金管理和控制的相關對策
(一)科學管理及利用預算資金
事業單位預算資金管理蘊含了資金預算功能，兼容了多個資金預算周期，包含年度預算，月平均需求計劃安排，日資金使用情況等，有效地把垂直型的資金預算數據結合到扁平化的資金結算平臺中來。資金預算自身不應該做為一種目的，而應當作為一種手段，預算的真正目的是控制。由于預算是以金額形式表明了資金管理工作的標準，從而本身就具有可考核性，因而有利于根據標準來評定工作成效找出偏差，如果找到偏差，立即采取改正措施，消除偏差，才能更好地對預算資金的控制以及管理。采取措施減少浪費，提高資金使用率。正確引導各職能部門學會花小錢辦大事，實力經濟適用效益觀念與勤儉節約的觀念，是有限的資金發揮最大的經濟價值。加強財務分析使用恰當的財務分析方法，并把分析結果及時反饋到有關部門，以便及時采取有針對性的措施。
(二)成立健全的財務資金管理制度，加強項目資金的核算，提高項目資金的使力度
根據事業單位的具體工作特點來制定制度標準。制定制度要講究系統和配套，制度與制度之間不能相互矛盾，還要加強財務制度建設，建立起行之有效的支出約束機制。這樣，可以做到有章可循，并且嚴格按照制度辦事，最大限度的提高各項資金的使用效益，在單位經濟活動中實行全過程、全方位的控制、管理和監督。加強事業單位預算執行監督也是深化預算的關鍵環節，主要是對資金的利用率進行重點的管理和控制。加強預算執行監管，可以指定必要的內部監督管理機制來進行管理，讓單位檢查、審核、主辦部門等直接參與到監督中來，對資金各個使用環節進行周密的控制及管理監督。做到對預算資金的使用過程監督的制度約束。確保資金安全和你的使用。另一方面是對資金的使用效益，尤其是項目資金的使用效率，要有機制來進行嚴格的考核，如資金使用不理想的就應考慮來調整預算編制的標準及方法，這樣才可以實現對資金的使用過程實時監控管理和及時控制。
(三)增強會計基礎工作，提高會計人員素質
會計工作薄弱嚴重制約了行政事業單位的內部控制和部門預算的實施效果。因此強化會計工作基礎，需要財政機關加強對事業單位會計人員的會計基礎工作規范，的培訓教育，提高會計人員的素質，從而保證會計工作的質量。只有這樣才能實施好各項財務管理制度，有效地發展監督作用從而杜絕不規范發生。事業單位在建立內部會計控制的時侯必須實施授權批準制來進行控制。這就要求事業單位內部必須明確規定涉及會計及相關工作的授權批準權限、范圍、責任、程序等內容，各管理層必須在自己的授權范圍內行使權力，一定要避免越權審批和相互推諉，必須做到職責分明、權力對等、有職有責、有責有利。為此，事業單位還要建立授權批準體系，這主要包括授權批準的范圍、授權批準的層次、授權批準的責任、授權批準的程序。其次，要在單位內部引入先進的管理手段，完善授權批準制度，加強事業單位的內部監督。從而做好事業單位說交給的對資金預算等管理工作。有了這些還要建立有效地捏不控制體系和制度，加強審計監督，同時健全各級經濟責任制，從領導到會計，審計監察部門的負責人，都要嚴格履行各自職責，層層防范，層層落實。
