行政事業單位為了切實提升會計信息的質量，保障資產的安全性，使得相關法律法規以及規章制度能夠得到有效地貫徹執行，就必須制定并實行科學有效的控制手段、措施以及程序，這就是行政事業單位的內部控制工作。這頂工作是事業單位完善內部控制與《會計法》的要求，也是事業單位加強內部管理的要求。
一、目前我們國家事業單位內部控制的現狀
(一)內部控制意識有待加強
內部控制環境當中一項非常重要的內容就是內部控制意識，它是內控制度能夠健全并實施的重要保障。很多單位的領導對于內部控制方面知識的了解十分欠缺。所以，對完善單位內部控制的重要意義缺乏足夠的認識。部分管理者甚至覺得，內部控制制度的建立其實建章立制，并未充分意識到內部控制制度是在業務運作當中循序漸進的動態監督與管理機制，也并未意識到管理者以及有關業務單位在內部控制當中必須履行、承擔的相應職責，只是將內部控制作為上級對下級的管理方式。部分單位在創建內部控制制度的時候，要么敷衍了事，照搬照抄，脫離實際，要么不思進取，安于現狀，使得所建立的內部控制制度沒有真正發揮作用。
(二)內部控制制度有待完善
直到目前為止，我們國家還沒有一套適用于事業單位的內部控制指導性規范，大部分的事業單位并未根據自身業務的具體特點研究設計一套科學、系統而規范的內部控制制度制度。盡管財政部制定并頒發的《內部會計控制規范》在方法、理念以及原則等各個方面適用于事業單位，然而其設計思路更加適用于企業。事實上，大多數的事業單位并未形成正規的內部控制制度，通常以常規的財經規章制度取代內部控制制度，管理過程中也只憑經驗，只是對開支范圍、標準進行限制，尤其對于業務流程的控制并不嚴格，產生問題的時候缺少統一規范的處理原則和標準
(三)監督約束作用有待強化
當前，大部分的事業單位的內部審計機構名存實亡，部分單位甚至根本未設置審計機構。單位的內審機構的人事任免權在單位領導手中，以及其經濟利益等都受制于單位領導，從而導致外部監督機制的缺失，而內部控制也無法發揮有效作用。
(四)部分事業單位財務工作者的內部控制意識十分薄弱，其業務能力比較差
良好的內部控制意識是保證行政事業單位的內部控制制度能夠進一步完善并得到有效實施的前提。部分事業單位比較重視建立制度，選擇先進的管理模式，然而并不注重其執行情況和效果，造成管理效果不明顯。另外，由于單位領導的重視程度不夠，打擊了有關工作人員執行內部控制制度的主動性與積極性，使得內部控制的作用無法得到充分發揮。
二、強化事業單位內部控制的主要策略
(一)提高管理者的內部控制意識
加強財政法規以及創建內部控制制度方面的培訓工作，提高事業單位負責人對于創建內部控制制度重要意義的認識，提高他們的內控意識，從而對創建內部控制制度的工作給予大力支持，為事業單位營造良好的內控氛圍。
(二)完善事業單位的治理結構
法人治理結構是行政事業單位內部控制環境的一項重要的內容，管理層通過實行內部控制，使之成為“單位之法”，對于單位的每個人都產生效力，務必嚴格遵守，誰都不能凌駕之上，進而達到在法律面前一視同仁。要不然的話，就會出現各種各樣的問題和漏洞。
(三)強化繼續教育與培訓工作，提高會計人員的素質
會計人員的素質對于會計信息質量有直接的影響，必須強化對會計人員的監管力度，提升會計隊伍的總體素質。作為一名合格的會計人員必須具備相應的專業知識與技能，充分了解國家相關法律法規以及現行各項會計制度。嚴格遵守職業道德，提高責任心，主動學習業務知識，提高業務水平。事業單位應當為會計人員提供必要的財力與物力的支持，改善他們的執業環境，財政部門也應當強化會計業務的培訓工作。從而建立起財政、單位以及個人三位一體的繼續教育與培訓機制，確保會計信息的質量。
(四)進一步完善相關制度為內部控制提供保障
進一步建立健全事業單位的內部資金使用制度是加快建立內部會計控制制度，切實維護財經制度，搞好增收節支工作，為加強財政管理職能的提供保障。建立規范的內部財務會計控制相關的管理制度，使得事業單位在內部控制手段、技術以及方法等各個方面有章可循，使得單位內部的會計機構以及崗位設置更加科學合理、權責劃分更加明確，以便降低資產損失的風險，進一步規范單位的會計行為，從而提升財政資金的使用效果。
(五)加強內部審計工作
事實證明，完善事業單位的內部控制制度的首要任務就是務必加強事業單位的內部審計工作，使之進一步制度化與規范化。并且完善內部審計制度，這是加強單位的內部會計監督，提升會計信息質量的有效措施，有利于對單位內部的相關規定的執行以及落實情況加以監督，掌握執行過程中存在的問題，及時反饋給單位管理層，以便及時完善制度、改進工作，使得內審工作順利開展。
