進入新世紀以來，隨著社會主義市場經濟體制的建立和完善，為了加強財政資金收支的管理和監督，規范財務管理和會計行為，提高財政資金使用效益；為了構筑公共財政框架、實現國庫集中收付制度，建立公開、高效、廉潔、務實的財政管理運行機制，全面開展會計集中核算工作已勢在必行。事業單位會計集中核算是在“三不變”即：預算執行主體地位不變、資金使用權限和財務管理權限不變的前提下，是以統一核算為手段、集中資金為基礎、加強財政資金收支管理為目標的一種財務管理模式，是財政支出管理的一項深層次的重大改革。
1.事業單位實行會計集中核算的重要性
1.1提高會計信息質量和工作效率。實行會計集中核算后，行政事業單位設報賬員負責辦理日常現金收支事務，會計業務納入會計核算中心統一核算，會計核算中心選配業務素質較高的專職會計，并運用會計電算化系統，嚴格按照國家統一會計制度進行核算，從而大大提高了會計核算工作的質量和會計工作效率，保證了會計核算資料的真實性、完整性、及時性和統一性。
1.2加強會計監督，減少了單位財務支出中可能發生的違規違法行為。實行會計集中核算后，單位支出都必須經過會計核算中心的審核，不合規定票據不予受理，不合理開支不予報銷；一定程度上減少部分單位在使用國家資金上的隨意性，給貪污犯罪和揮霍浪費行為亮起了紅燈。
1.3強化預算管理，提高了財政資金使用效益。實行會計集中核算，能夠全方位，全過程掌握和監督各單位每筆資金的活動情況，核算中心為預算的編制提供了準確的信息和基礎的資料，也促使單位嚴格執行預算，保證其支出的有序性、計劃性，從根本上杜絕在預算執行中的克扣、截留、挪用等現象。
1.4為進一步實施國庫集中收付制度奠定了基礎。實行會計集中核算后，會計核算中心為財政部門提供了準確的會計信息和基礎資料，財政部門能夠及時掌握各核算單位真實、可靠的會計信息，經過綜合分析，為財政宏觀管理提供服務，從根本上改變財政管理分散的狀況，有利于財政部門對資金加強統一調度和管理，保證資金使用的有序性和計劃性。同時，會計集中核算系統先進的計算機網絡系統，為國庫集中收付制度的建立奠定了堅實基礎。
1.5監督職能進一步體現，核算單位財務行為得到進一步規范
會計集中核算以后，財政部門的監督領域得到進一步拓展，通過會計核算中心，實現了財政對核算單位資金收付全過程監管，特別是對支出的方向、結構、規模等方面的監督，把許多不合理的支出消滅在萌芽狀態。各核算單位的財務行為得到進一步規范，改變了過去資金使用上的隨意性，增強了財務收支活動的規范性，避免了多頭開戶、多種賬戶、多渠道流出等現象的發生，提高了各核算單位自我約束，自我監督的自覺性，堵塞了一些單位少扣稅或不扣稅的漏洞，切實發揮會計核算作用，增加了財政收入。
2.目前會計集中核算存在的問題
2.1核算單位的財務管理和內部監督弱化。實行會計集中核算后，財務管理保留在原單位，而會計核算工作由會計核算中心完成，這使得財務管理與會計核算脫節，不利于財務工作的有效進行，加上很多核算單位將會計核算和財務管理等同起來，導致單位的財務管理工作弱化。另外，由于核算單位內部的會計與出納牽制機制消失，報賬員實際上履行了會計出納雙重職責，造成了財務內部監督工作的“空檔”和“缺位”，影響了單位經濟業務活動健康有序進行。
2.2 會計責任主體不明確。我國《會計法》規定，單位負責人對本單位的會計工作和會計資料的真實性、完整性負責。會計集中核算在一定程度上改變了單位的核算權和會計監督權，也相應地改變了會計責任主體資格。由于審計部門與被審計單位之間增加了“中間人”——會計核算中心，會計核算中心與被審計單位之間可能就一些會計責任問題出現真空，使得資料提供、具體問詢、責任認定難度加大。
2.3 制度不健全，缺乏可行的、統一的經費開支標準。在會計集中核算實踐中，現行行政事業單位開支標準與具體繁雜的實際支出有較大差距，常常會遇到合理不合法或合法不合理的報銷事項。
2.4控制和監督職能弱化。首先，單位會計核算工作移至會計核算中心，而財產物資仍由原單位進行管理，這種資產管理與會計核算相分離的情況，導致核算單位資產管理與會計核算的分離，失去了實地實時監督的優勢。其次，單位報賬時，會計核算中心往往只注重票據是否合規、審批手續是否齊全，而對票據內容的真實性無法判斷，一些單位為了使一些不合規的支出合法化，可能采取巧立名目、弄虛作假的手法進行報銷。
3.完善會計集中核算的措施
3.1 加強核算單位財務管理，強化財會隊伍建設。首先，核算單位與會計核算中心要切實加強橫向交流聯系，建立互補、互促、互動的分工協作機制，切實解決單位財務管理與會計核算脫節的問題。其次，完善核算單位內部會計控制制度。第三，加強報賬員的管理和培訓，提高其專業水平，加強國家各項財政法規和職業道德的教育，使其充分發揮會計集中核算的紐帶和橋梁作用。
3.2 建立健全各項制度，規范支出審批程序。由于現行的資金支出標準缺乏可行性，執行起來較困難，所以建議有關部門根據本地區的實際情況通過調查研究，盡快制定一套切實可行的經費支出標準及福利補貼制度，逐步規范單位各類分配支出標準，使會計集中核算有法可依，保障會計集中核算制度規范運行。同時，建立會計核算制度。
3.3 增強責任意識，明確責任主體。會計集中核算，并沒有改變核算單位的經濟體制與經濟地位，且會計原始資料來源未變，會計核算基礎未變，資金使用權和財產所有權未變。因此，核算單位負責人理應是單位的會計責任主體，如果會計核算資料的真實性、完整性摻進了雜質，出現了問題，按照《會計法》的規定，會計核算中心相關責任人員也理應承擔一定的責任。
3.4 加強內部控制與監督。首先，強化核算中心的監督管理職能，從核算型向管理型轉化。其次，建立健全核算中心內部監督和外部審計監督等監督制約機制。
總之，實行會計集中核算，猶如一道堅固的防線，較好地預防和阻止了各種違法違紀行為，從源頭上制止了腐敗發生的可能，為建立公開、高效、廉潔、務實的財務管理機制積累了寶貴經驗。盡管在實踐中會計集中核算還存在許多問題需要完善，但我們既不能急于求成，又不能流于形式，應實事求是、總結經驗、不斷完善，促使其健康發展。時代在前進，實踐在發展，會計集中核算工作也應與時俱進，努力為財政管理制度改革作出貢獻。
