內部審計是由部門、單位內設的審計機構從內部對其財務收支的真實性、合法性和效益性進行審計監督。內部審計具有不同于外部審計的特征，并在經濟發展中發揮著獨特的作用。當前市場經濟環境日趨復雜，如何把握關鍵，有的放矢地對經濟活動進行監督，有效地開展內部審計，是內審工作應該注重的新課題。隨著國家醫療體制改革的不斷深入,醫院內部審計顯得越來越重要，研究和探索醫院內部審計工作的現狀和問題，改進醫院的內審工作已經變得日益緊迫起來。但在審計實踐中，醫院內部審計工作顯得相對滯后，亟待我們尋找存在的問題，探索解決的措施。
1.醫院內部審計工作中存在的問題
1.1 對實施內部審計的認識存有偏差。
有些醫院領導對內部審計的職能和作用在認識上存在誤區,認為內部審計工作可有可無。單位內審部門的設立只是為了應付上級檢查而設置的,沒有具體的工作目標,沒有將內審工作納入到日常管理的軌道上來,甚至于錯誤的地認為內部審計等同于紀檢監察。這些錯誤的觀念，嚴重地阻礙了醫院內部審計工作的開展。有的內審人員認為,審計工作容易得罪人,工作缺乏主動性、積極性,“等、靠、要”思想嚴重,有的即便發現問題,也不敢請示、匯報,致使國家財產遭受損失?！ ?.3 建立健全內部審計機構。
醫院內部審計機構的設置是實施內部審計工作的組織保證,設立科學、合理的內部審計機構,是實現內部審計職能的重要保證。如果沒有健全的內部審計機構,完善的內部監督約束機制,在多數情況下都會出現財務管理混亂、跑冒滴漏、腐敗行為滋生的現象。因此,醫院應按上級部門的要求,在本單位主要負責人直接領導下,建立同本單位其他各職能科室相平等的、獨立的內部審計機構,特別要求的是與財務、紀檢、監察部門分設，不能有行政隸屬關系，內部審計機構要在本單位主要負責人的直接領導下，獨立行使內部審計職能，對本單位主要領導負責并報告工作。明確內審機構的地位,對內部審計機構的人員配備實行專職化,并且保持其穩定性,充分發揮內部審計的監督、評價、管理等職能,使內部審計機構成為醫院管理所必不可少的一個機構。
2.4 完善制度化建設。
法律法規是審計人員的依據,完善內部審計機制,按照國家審計法律法規和國家的財經法規的有關規定,制定內審人員的崗位責任制、審計工作計劃,審計工作程序等相關的、可供操作的內審制度。使醫院內部審計工作按照內部審計規范所規定的程序、方法、內容等開展各項審計工作，從而實現內部審計工作的法制化、制度化、規范化。同時,應建立健全內部審計的控制制度和激勵機制以及責任制度，規范內部審計人員的行為,明確內部審計的職能和權限,在審計部門內部建立嚴格的考核制度,并依據工作業績和工作標準,對審計工作質量執行量化考核,從制度上保證醫院內部審計工作的順利開展。
2.5 拓寬工作領域,發揮服務監督職能。
隨著社會主義市場經濟體制的建立與完善,單位對內部審計的要求不斷提高,醫院內部審計已不能只停留在監督的角色上,而必須擴大自身的審計范圍,發揮內部審計對醫院經濟工作的綜合監督職能,并向效益管理延伸。
現在，衛生事業單位內部審計人員往往將主要精力投入到財務數據的真實性、合法性的查證及財務收支的監督上，內審主要職能就是防止差錯而不是對單位財務信息進行分析、控制及提出合理化建議。審計工作主要是從會計報表、賬本、憑證及相關資料著手。其主要工作都集中在財務部門而未深入到管理和經營領域。例如，對房屋修繕費的審計中，往往只審核預算的定額、造價，對施工中隱蔽工程的事中審計則常常忽視，不能確保工程的質量。又如，對衛生材料采購的審計，往往審核其支出余額與發票是否相同，相關手續是否齊全，而不注重廠家、品種的選擇，數量、單價的確定，審批、采購、驗收各環節的相互結合。事實上，單位真正存在的問題通常發生在細微之處。因此，對單位的內控制度不能進行系統和權威的評價，無法發現單位的漏洞，也無法對單位管理者提出建議。隨著會計制度的逐步規范，外部制約機制的加強，內部管理水平的提高，財務核算上的差錯會越來越少，內審的職能也應從傳統的防止查錯轉向為管理決策服務。內審的重點應從內部檢查和監督向分析和評價方面轉變。內審也不能只局限于財務部門，它將擴展到單位經營和管理的各個領域。
應該強調的是,審計不是最終目的,它只是一種手段,內部審計工作的最終目的應該是幫助和促進醫院各職能部門提高其經營管理水平與效率,實現監督與服務并舉。要把內部審計寓于服務之中,寓于醫院管理的各個環節。
2.6 不斷改進工作方法和手段，提高內部審計工作質量。
通過實施“三個結合”不斷改革內部審計的工作方法和手段：一是事前審計與事中、事后審計相結合，即將審計監督的關口前移，把問題解決在萌芽狀態或初始階段。隨著單位管理水平的提高，內審的作用應不僅限于事后監督，更多的應是事前預防與事中控制。它將對單位進行全過程、全方位的監督和評價。單位的預算、設備購置計劃、資金使用、投資計劃等均應做到事前審核，事中控制，以便及時發現各個環節存在的問題，把單位風險降到最低。二是微觀審計與在宏觀方面發揮作用相結合，既從宏觀調控和宏觀管理的要求出發安排審計項目，又在審計若干具體項目后，綜合加以分析，找出共同性或傾向性的問題及其產生的原因，有針對性地提出解決的意見和建議，為領導決策提供依據，為規范單位財務收支行為提出建議；三是對審計發現的問題堅持治標與治本相結合，對審計發現的問題既要恰當進行處理，又要深入分析產生的原因，從幫助建立健全各項規章制度和內部控制制度、加強管理工作等方面從根本上加以解決，使之不再有重復發生的可能。
