我軍綜合大學是以“綜合環境育人、整體力量辦學、系統規劃建設、規模效益發展”的辦學性質和宗旨為指導，由學科專業相關、院址地域鄰近的多所專業學院合并組建而成。我軍綜合大學是新型軍事院校體系的支柱力量，建設軍隊綜合大學是軍事院校發展史上特定軍情和階段的嶄新課題。組建綜合大學的過程是一個“合編、合心、合力”的磨合轉型過程，決不是簡單地合并累加，而是根據使命、職能、定位的變化進行實質性地融合，開創規模化辦校、現代化教學、正規化管理、社會化保障的綜合大學格局。
一、存在的主要問題
第一，建章立制工作有待深化，規范化管理需要加強。軍隊綜合大學的財務管理規章制度體系雖然已初步建立，但對于新問題、新事務缺少細化的規定，仍按照建制部隊的上下級管理關系和模式，進行管理權限的劃分，缺乏院校、科研院所的特征，特別是缺乏綜合大學的特點和針對性，是較為簡單、片面、粗線條的制度體系。此外，由于大學財務管理規定較為粗放，并且指是起到宏觀規范和指導作用，各專業學院制定的財務管理規章制度有與之相悖的情況，規章制度有失統一、規范，影響了制度的權威性和嚴肅性，迫切需要規范化管理。
第二，校、院關系本位主義明顯，財務有待統一。一是軍隊綜合大學由幾家專業學院合并組成，合并后從各專業學院抽調人員新建一個大學機關，各專業學院基本保持原狀，形成“立足大學辦學院、依靠學院辦大學”的小機關、大學院的辦學格局，其實質上就是增加一個大學管理機關，各學院仍自成運行體系。這種校、院兩級的體制，在沒有實現實質性融合的情況下，本位主義的表現嚴重。二是個別單位嚴重違反規定，人為分割院校兩級管理，在院校調整、系室重組的過程中突擊花錢、集中發錢，導致大學和單位家底經費這個原始基礎的空虛。三是少數學院領導忙于出“政績”，熱情有余，理性不足，不與大學的建設步伐保持一致，急功近利地將有限的經費用于“形象工程”建設。
第三，部門家底校、院黨委難以動用，條塊關系緊張。校、院主管作為黨委班子核心主抓全面工作，直接抓財務工作，一般往往把注意力放在優化校區布局、基礎設施建設、改善辦學條件等事關全局的硬件建設上，這些硬件建設主要屬于行管后勤工作，看得見、摸得著，經費執行情況容易掌握，有硬性指標可供考核。而教學科研工作雖然是中心工作，但考核工作成效的標準是具有彈性的，投入與產出效益比不易衡量，分管領導往往會從部門角度出發，關起門來辦好自家事，只管伸手要保障，對于大學發展的關鍵環節之所急卻無動于衷，部門利益思想嚴重。因而易導致校、院黨委難以動用部門家底經費進行宏觀調控、綜合平衡，出現“條塊結合、以塊為主”的局面。
二、深化改革的目標
目前各大學初步形成了綜合基礎型教學、科研與教學并重、軍事化管理與開放創新式辦學的建校思維共識，樹立大學意識、凝聚人員思想、優化學科重組、加速隊伍建設，立足現有條件有重點地進行穩步建設，實現了“1+1>2”的實質性合并，顯現規模化后的學科互補和教研資源共享優勢，密切結合部隊建設需要，培養高素質復合型軍事人才，研發高水平軍事科技成果，爭創國際一流軍事學府。辦學理念的科學定位為開展系統化財務管理機制改革指明了方向。就財務管理機制改革而言，筆者認為必須在研究如何使教學科研經費圍繞教學科研設施建設、網絡化教學平臺建設更好投入使用，使行管后勤經費圍繞大基礎合訓、科技興管、社會化保障、與校區發展規劃配套的基礎設施建設等方面做好保障的基礎上進行目標的定位。
第一，鮮明的綜合大學集中統管意識。所謂軍隊綜合大學，首先體現的就是“綜合”二字，即學科的綜合、隊伍的綜合、管理的綜合、保障的綜合。財務管理機制的深化改革首先就要在“綜合”二字上做文章。綜合大學意識是綜合大學財務管理假設的前提之一，也是改革的目標之一，深化綜合大學財務管理機制改革必須以樹立鮮明的綜合大學意識為指導原則和設計基礎，并且不斷鞏固其在財務管理意識形態中的地位。
第二，制衡的綜合大學財權配置結構。形成權力制約和均衡的財權配置結構是軍隊綜合大學財務管理機制改革的一個基礎目標。目前綜合大學財權配置呈現的是統管無力、過于分權狀態，權力缺乏制約、格局出現失衡，必然導致財力的分散、流失、浪費，宏觀調控乏力。因此，建立此目標要做到以法制權、以權制權、正確處理集權與分權的關系，通過制度規范和合理界定校、院黨委、部門間的財權配置，構建集中統管、集體理財、職能均衡、權責明確、民主制約、程序簡捷的財權結構。
第三，健全的綜合大學財務管理制度體系。規章制度要跟得上客觀形勢發展，并起到規范、約束、指導作用。健全的財務管理制度體系是指：一要獨具特色。依照軍隊財務管理原則，而不拘泥于全軍性財務管理規定，要從軍隊綜合大學的現實需要出發，按照辦學特色，設計具有可行性、富有指導性和前瞻性的制度體系。二要綜合全面。凡是軍隊綜合大學需要制度規范和調整的經濟活動，都應有相應的財務管理制度，能夠涵蓋綜合辦學后出現的新事務。三要結構嚴謹。各類、各層次財務管理制度之間要彼此銜接配套，不能重復、交叉甚至矛盾。四要協調發展。我軍特定發展時期創建的軍隊綜合大學具有鮮明的變革性、階段性，隨著新軍事變革和軍隊綜合大學建設的迅速進行，財務管理制度體系要隨同與時俱進，建立一個嶄新的開放體系。
