內部審計機構實施的離任經濟責任審計，主要是針對企業集團下屬各單位主要經營負責人任職期間的經濟責任進行審計，是結合日常的財務審計及經濟效益審計進行的，通過審計資料和信息的積累，為離任經濟責任審計服務。由于經濟責任審計具有涉及面廣、綜合性強等特點，對審計方法提出更高的要求。以下就企業內部審計機構進行經濟責任審計如何有效地進行做一簡要的探討。
一、 前期準備工作
1、經濟責任審計委派書的取得。內部審計機構在進行離任審計之前，必須取得董事會或類似權力機構的書面授權之后或根據公司相關制度規定，才能開始實施審計工作。在實施離任經濟責任審計之前，審計人員應該與委托人進行良好的溝通，在進行經濟責任鑒定時，委托人的支持力度是非常關鍵的。
2、審計通知。在取得審計委派書之后，必須對被審計人與單位發出審計通知書。審計通知單的內容包括審計時間、審計范圍、被審計單位財務部門應作的準備工作，以及要求被審計人提供的材料，如離任述職報告等。
3、取得被審計單位主要部門的支持。與被審計單位主要部門進行溝通，有利于審計活動順利實施，對搜集到真實的信息資料，及時反映在審計過程中未覺察到的問題有很大的幫助。
二、 審計工作實施
1、存量資產的核實。存量資產的核實是經濟責任審計所關注的重點，其一，委托人需要對被審計人任期內資產的安全性、增值性等進行核實；其二，離任人與接任人都要求對企業的存量資產進行審計核實，以劃清前后任的經濟責任歸屬。因此，在實際審計工作中，審計人員應嚴格遵守謹慎原則。例如，對于資產報廢的認定，必須有親歷證據(如房屋毀棄現場等)或者有相關技術鑒定書，否則就不能確認。
2、真實負債情況的核實。對負債情況的核實，主要集中在被審計單位是否隱瞞情況，被審計人可能以隱瞞部分負債，以達到粉飾其任期業績的目的。
在核實負債情況的工作中，除了檢查未入賬合同或其他財務資料外，還可以與接任者進行溝通。作為接任者，最關心的問題之一就是未反映出來的負債情況。他從不同的渠道也許能得到一些相關信息，且接任者對審計工作的細化要求相對離任者要高得多， 這些信息可為我們進行深入的審計調查提供線索。
3、潛在損益的核實。在實踐中發現，幾乎每一個企業都存在著未入賬的費用與收益。產生這種情況的原因有很多。從潛在費用方面來說，主要原因為：已支出但未及時入賬；損失已經形成，但由于主觀或客觀原因而未入賬；已經發生但相關部門認為不合理的費用等。從潛在收益方面來說，主要原因為：為了避稅等原因而考慮多列費用部分，比如多計折舊等；收益已經實現，但由于票據等原因未入賬。
上述情況隨著經營活動的繼續，在將來形成或部分形成費用或收益入賬。由于交、接雙方不同角度的要求，他們對此類事項處理的態度也不一樣，給審計人員在進行核實清理時造成困難。在核實潛在損益時，審計人員搜集到完整的資料后，可以先按照會計處理方法與原則，對會計報表進行調整，由于票據未到，不能入賬部分單獨列表進行說明，再與雙方征求意見，在掌握主動權的前提下協調雙方的意見。當不能達成一致時，可以從尊重客觀事實出發，向審計委托人征求意見，達成共識后，進行確認。
三、 根據審計結論進行經濟責任審計評價
企業經濟責任審計的目的是對企業負責人進行經濟責任評價，對其任期的企業經營狀況發表審計意見，界定企業負責人在本單位經濟活動中應負何種經濟責任。
經濟責任審計評價內容包括：企業資產、負債、損益的真實性、合法性和會計處理方法的一貫性；企業資產的質量狀況；企業經濟效益情況；企業相關經營目標的實現情況；任期重大事項(如玩忽職守造成重大損失、貪污賄賂等)。
進行企業經濟效益評價時一般采用一系列經濟指標進行。如對其資本保值增值情況的評價可采用財政部頒布的指標，對資本積累、凈資產收益率、總資產報酬率、不良資產比率等進行分析評價。對盈利能力的評價可采用總資產報酬率、資本金利潤率、投資回收率、投資權益率等比率進行分析評價。由于各企業的實際情況不同，在選擇經濟指標進行評價時也可因地制宜地選取最能反映出經營活動真實情況的經濟指標。在對經濟指標進行評價時，應采用審計調整后的數據進行計算。
