新會計準則實施以來，會計業務發生了很大變化。原有的ERP系統已無法適應新會計準則的要求，需要在以下幾個方面作出相應的調整。
會計科目調整。在ERP軟件的調整中，首先，軟件一般提供了新的會計科目模板。成熟的ERP軟件設置會計科目都比較靈活，一般的科目調整可以通過新增、刪除、修改、停用等實現，當然也需要修改各種會計科目核算項目分類、財務分析類別調整等相關內容。企業可以根據實際情況對科目作出調整。特別需要企業注意的是那些科目名稱未變而內涵發生變動的科目。例如“應收票據”，新會計準則取消了“應收票據不得計提壞賬準備，但是，如有確鑿證據表明企業所持有的未到期應收票據不能收回或收回的可能性不大時，應將其賬面余額轉入應收賬款，并計提相應的壞賬準備。”這一內容，在“壞賬準備”科目中明確應收票據也要計提壞賬準備。在ERP系統中這樣的科目修改牽扯到計提應收賬款系統的處理模式，涉及到系統內部多項設置，大多數系統通過升級系統實現。
報表調整。新會計準則對現行的財務報告披露要求進行了全面的梳理，創造了較為完整的財務報告體系。企業會計準則要求企業必須編制資產負債表、利潤表、現金流量表、所有者權益變動表和附注。其中，所有者權益變動表是新增加報表，其他報表格式均有變化，特別是利潤表，將原來的五大部分改為四大部分，取消了主營業務利潤，直接用營業收入減營業成本計算出營業利潤。
軟件在新科目基礎上，調整了現有的預置報表格式和賬簿。例如現金流量表中投資活動的現金流量項目增加了“處置子公司及其他營業單位收到的現金凈額”、“取得子公司及其他營業單位支付的現金凈額”，現金流量表補充了“公允價值變動損失”等。ERP軟件總賬系統及報表管理系統根據新會計準則對現金流量表格式的要求，更新了預設的現金流量項目及現金流量表格式，滿足了企業對新現金流量項目和報表格式的需求。
同時，企業自身也需要在系統中重新定義一些報表，對于ERP系統常用的核算項目，也需要做出一定的調整。對于報表、賬簿、核算項目等的運算模式均需要做適應性的調整。例如對于新會計準則中合并的科目，如職工薪酬、周轉材料等，既可以根據企業實際情況分設下級科目，也可以通過分別設置核算項目來了解明細情況，以更好地滿足新會計準則的要求。
合并報表的調整。在新會計準則體系中，企業合并的會計處理發生變革，合并財務報表的基本理論也在發生變革。這進一步規范了合并報表范圍的確認，強調控制權，只要對子公司有實質性控制，均需納入合并的范圍，所有者權益為負數的子公司只要持續經營也應納入合并范圍。ERP系統中對這個變動的調整主要體現在對合并報表的調整上，例如對合并報表項目、現金流量項目的調整。新會計準則中要求披露新增的合并組織以及對利潤、關聯交易等方面的信息，對此，ERP系統中目前沒有很好的實現方式。由于ERP系統更為注重流程，即業務的關聯性，故此類披露信息的增加，一般通過系統提供的報表和商業智能分析等方式簡單實現，但相當一部分工作需要從業人員的調整。
業務到財務單據流轉調整。ERP體現的主要思路即業務與財務的協同。新準則科目的變化要求相應的業務單據向會計憑證轉化，這會產生大量改動。這一工作一般是ERP系統提供一定模板供企業參考，企業依照自身實際情況修改模板，從而實現程序化的業務與財務對接。新會計準則使得現有業務到財務的單據體系發生較大的改動，在ERP系統中需要對先前提供的單據模板做大量的修改，同時需要企業在新科目運用升級過程中做出符合企業自身狀況的調整。
