反洗錢工作的會計應用，應有一套完整的制度設計與安排，建立有效的會計信息系統，以會計核算為平臺，以會計制度為載體，以會計監督為手段，全面有效地進行設計。
從會計核算組織體系入手建立有效的反洗錢工作機制。一是金融機構反洗錢管理職能應落到財務會計部門或專門的反洗錢職能部門，以便于統一協調和指揮反洗錢工作，避免交叉管理降低反洗錢工作效率；二是確立反洗錢業務操作模式。以會計核算部門和客戶部門為操作主體，以會計核算組織為平臺，依據反洗錢業務需要補充和完善會計制度，將反洗錢規定和措施落實到會計業務當中，確保會計業務的客觀、嚴謹與一貫性；三是根據金融機構內設部門的設置及扁平化管理的工作要求，考慮會計隊伍的穩定性和綜合柜員半日班的工作特點，設計與落實反洗錢會計崗位的重心，如一線柜員負責柜面客戶盡職調查，二線人員負責整理、篩選可疑交易報告（建議由事中監督人員擔任大額及可疑資金交易的分析、篩選、報告工作），建立有效的傳遞和匯報制度，便于主管和領導能及時掌握反洗錢信息和工作動態。
從會計交易信息要求入手確立真實的會計信息標準。交易信息是反洗錢最核心的要素，是開展客戶盡職調查、甄別、分析、篩選可疑交易的重要依據。一是規范結算工具信息填寫要求，如資金用途欄應明確具體的用途。二是補充和完善大額交易“付款依據”規定。三是規定電子支付工具信息記錄功能。
從會計信息審核要求入手制定規范的客戶盡職調查程序。從業務需求、行為規范方面予以要求，制定各種資金交易類型情況下的客戶盡職調查的流程。如開立賬戶時的客戶盡職調查流程、現金交易時的客戶盡職調查流程、付款依據審查的客戶盡職調查流程等等，這樣既可提高金融機構臨柜人員甄別信息的能力，又可有效規避金融機構工作人員因進行客戶盡職調查，可能出現泄密事件所承擔的法律責任，具有一箭雙雕的作用；成效上，由于每個盡職調查環節均作了具體的程序化規定，客戶對此調查與詢問得到了充分的理解與認可，雙方取得一致的信息響應，避免了認識上的誤解，提高了客戶盡職調查的主動效果。
從會計核算賬務組織入手完善會計信息工作平臺。建立和完善四個層次信息載體的平臺，提高對資金交易信息的甄別、分析、調查、檢查效果。一是賬戶設置時的信息載體，進一步規范必須的客戶盡職調查基本材料，并在核算系統中進行充分的展示，如開戶單位的基本面情況；二是規范憑證實時交易的信息載體，對交易情況進行充分的揭示，如交易性質和資金用途；三是統一各金融機構間的賬簿載體，發揮賬簿組織的“總括”的功能，如收付單位名稱、交易性質、用途等，對交易信息進行高度的集中和反映；四是增設反洗錢信息情況表，統一反映本單位大額和可疑交易的異動情況，以提高反洗錢工作人員對大額或可疑數據的敏感程度。
從會計信息分析手段入手建立有效的甄別、分析體系。一是增加會計分析內容，將反洗錢信息列入日常分析范圍，建立日常分析的長效機制；二是確定分析模式、分析方法，列入分析指標，如交易雙方是否為業務關聯、交易雙方資金往來頻率等，構建有效的分析體系，適時開展對大額及可疑資金交易的研判，定時進行可疑交易的篩選與分析；三是增強保密功能，確定保密人員和范圍，由于反洗錢信息具有高度的保密性，因此對反洗錢信息的來源和使用必須規范和嚴謹，包括分析人員的構成、職責與責任。
