專項資金是為完成特定工作任務或實現某一事業發展目標而安排的具有專門用途的資金。從預算管理的角度來說，專項資金是指財政部門或上級單位撥給行政事業單位，用于完成專項工作或工程，并需要單獨報賬結算的資金，其在整個財政預算資金中占有相當大的比例。近年來，隨著國民經濟的不斷發展，政府投入到各領域、各行業、各重點項目的專項資金越來越多，所占財政預算資金的比重也越來越大，因此，規范事業單位的專項資金核算，對于加強事業單位財務管理，提高財政資金使用效益，強化事業單位的職能有著十分重要的意義。
一、事業單位專項資金管理存在的問題
目前，隨著事業單位專項資金管理的金額越來越大，在專項資金管理中也呈現出眾多問題。
(一) 專項資金的管理制度存在漏洞，約束力不強
現在不少事業單位專項資金的管理制度存在漏洞，一是管理制度不明確，條款制定得過于籠統，對專項資金管理缺乏力度，造成制度落實不到位；二是管理制度陳舊落后，與單位的實際情況不相符，缺乏可操作性，無法貫徹實施；三是管理制度僅僅是“掛在墻上，寫在紙上”，應付檢查而已，實際操作起來往往根據習慣性做法操作，“規定一套，執行一套”，使制度流于形式，缺乏約束力。
(二) 專項資金的財務控制缺失，財務人員不能充分發揮應有的作用
在相當一部分事業單位，財務人員在專項資金的管理中只是承擔了會計核算和資金支付等簡單的服務性工作，各項支出基本上是實報實銷，對項目的決策和實施了解不多，無法根據項目進度合理安排專項資金的使用，難以對各項目的事前和事中進行必要的輔助控制，發揮不了財務人員應有的作用。
(三) 專項資金的預算基礎組織工作不到位，相關人員的職業素質和業務水平較低
在專項資金的預算編制過程中，有些事業單位沒有統一的預算編制用表，對基層預算編制人員又沒有進行必要的培訓，編制的預算格式五花八門，財務部門在匯總時往往費時費力；有些事業單位對專項資金的預算基礎工作準備不充分、不詳細，制定預算方案時不夠認真、嚴謹，編制的預算并未細化到具體項目；有些事業單位沒有針對本單位制定簡短精要的預算編制要求，各基層預算編制人員又不愿意花太多時間研究財政部門下發的厚厚一本預算編制說明，最終匯總到財務部門的預算大多無法達到編制要求；有些事業單位參與專項資金預算編制的相關人員職業素質和業務水平較低，對預算編制工作應付了事，無法提供預算編制所需的基礎資料。
(四) 專項資金的項目管理混亂，預算與執行脫節
在實際操作中，不少事業單位存在專項資金的項目管理混亂，預算與執行脫節的現象，如：有的單位不管項目是否能批準，其前期經費都在經常性經費中列支，擠占了經常性經費；有的單位為了爭取更多的專項資金而盲目立項，資金到位后就將其挪用到其他項目；有的單位在項目完成立項資金也已到位后，因實際條件發生了變更，并未實際支出，最后該部分專項資金轉入單位的其他收入；有的單位項目多、資金量大，隨意在各項目資金之間相互調劑、混合使用，導致一些項目未能按預算規定的要求實施；有的單位從單位利益和個人利益出發，認為專項資金“不用白不用”，隨意變更項目資金的使用用途；有的單位為了不進行招投標，將項目拆分成若干個小項目，逐個發包，既增加了項目管理的難度，也使項目的整體效果大打折扣。
(五) 專項資金的使用不規范，存在濫用、亂用專項資金，造成浪費
一些事業單位對專項資金沒有進行單獨核算，與正常支出和公用支出相混淆，資金使用不規范；少數事業單位的部門預算只管要錢，重復、超標建設項目、購置設備，由于利用率低，造成資產、設備閑置，“花大錢，辦小事”，資金浪費的現象比較嚴重；還有個別事業單位為了未支付的專項資金在年底不被收回，違規采取先付款，后施工的辦法，先行支付全額的項目資金，造成專項資金的流失。
二、事業單位專項資金管理問題形成的原因
事業單位專項資金管理中存在的上述問題降低了財政資金使用效益，阻礙了事業單位職能的發揮。要想解決這些問題，需要深挖其產生的原因，以便能對癥下藥改善事業單位專項資金管理效益。
(一) 單位主要負責人法律意識淡薄，對專項資金的管理工作不夠重視
目前，事業單位的主要負責人對專項資金管理存在“重申請、輕管理、輕監督、輕績效”的問題，只注重項目的申請，卻不重視項目的實施和管理，對建立健全本單位專項資金管理制度，規范專項資金使用過程的監督機制，完善專項資金使用效果的績效評價制度，缺乏足夠的重視。
(二) 不注重專項資金的財務控制，財務角色被弱化
由于事業單位主要負責人對專項資金的財務控制意識薄弱，對財務人員的重視程度普遍不高，財務角色在專項資金的管理過程中被弱化，導致財務職能不能有效實現，影響對專項資金的統籌規劃，不利于提高專項資金的使用效果。
(三) 專項資金管理的相關人員業務素質有待提高
為了加強事業單位的專項資金管理，財務人員作為重要參與者，業務能力和職業素養需進一步提高，尤其是基層財務人員，業務水平普遍偏低，不能按要求核算專項資金，甚至不能合理使用會計科目。相關業務人員如基層預算編制人員，他們大都不是專職從事預算編制工作，因而對專項資金的管理水平參差不齊，需加強學習和培訓。還有一些項目管理人員，對項目管理的相關制度和辦法不夠熟悉，業務素質有待提高。
(四) 財政監督及過程管理缺乏力度，對專項資金的項目監管不力
財政專項資金管理辦法不夠健全，尚未做到一個專項資金或一類專項資金一個管理辦法，給管理和控制帶來不便。同時，財政監督力量不足，方式落后，突擊性、專項性檢查多，事后檢查多，對某一事項和環節檢查多，全方位跟蹤監督少。對于一些不按預算執行或隨意改變項目用途的問題監督缺乏應有的力度，直接影響了財政監督的權威性和有效性。
(五) 專項成果管理缺失，缺乏專項資金績效監督機制
財政管理上只管撥款，不問效果，部門和單位只管要錢，不講效益，投入產出無法直接掛鉤，專項成果無從衡量和考核。有效的績效監督機制尚未完全形成，處于起步階段，相應的法規制度辦法不夠健全，使績效監督工作缺乏制度保障。
三、改善事業單位專項資金管理的措施
通過上述對事業單位專項資金管理存在的問題及其產生原因的分析，可以從以下方面改善事業單位專項資金管理。
(一) 加強領導的法律意識教育，完善專項資金管理制度，形成有效的專項資金管理機制
制度的作用在于指導實踐，完善的專項資金管理制度是管好、用好專項資金，提高事業單位發展能力的重要保障。建立專項資金管理制度，應該從專項資金的預算、使用、項目結算及資金使用效果的績效評價等四個環節進行制度規范，完善并細化各環節的實施辦法及操作流程，形成一整套行之有效的專項資金管理機制，從而使項目的開展和專項資金的使用做到公開、透明。
(二) 強化財務控制意識，準確定位財務人員角色
事業單位應提高對財務工作的重視程度，強化財務管理職能作用，將財務的職能定位于全面參與資金使用的決策與控制。財務人員應該參與到專項資金管理的全過程，對于整個過程進行統籌規劃，以保證資金使用的高效率。事業單位要采取各種措施強化單位內部財務部門對專項資金的監管，切實管理好單位的各項資金。
(三) 加強預算管理，加強人員培訓教育
首先在預算編制過程中，應做到立項科學、切實可行、資金安排適當，確保專項資金及時足額到位，滿足項目建設的資金需求，應當建立預算編制制度并統一預算編制表格和編制程序，細化預算，使預算支出落實到每一個項目的具體開支上；其次加強對參與專項資金管理相關人員的培訓教育工作，要熟悉法律法規，提高政策理論水平，熟練掌握業務知識，提高業務能力，做到依法理財，規范管理，使專項資金預算編制管理的整體水平得到提高。
(四) 堅持專款專用原則，強化監督專項資金的項目管理
事業單位要對專項資金實行單獨核算、專款專用，嚴格按規定的用途、標準使用和管理專項資金，自覺接受有關部門的監督檢查；強化資金管理，建立健全內部監督制約機制，防止和杜絕專項資金使用過程中的違規現象；財政部門要建立專門監督機構的檢查與資金管理部門的日常跟蹤問效相互結合、與預算編制部門相互協調的財政監督機制，使其對專項資金的監督貫穿于財政活動的全領域、全過程。財政監督方式要走出事后集中性檢查的套路，把重心轉到事前控制、事中監督上來，實現全方位、多層次、多環節的監督。
(五) 實施專項資金績效評價，促進專項資金規范核算，提高專項資金使用效率
專項資金績效評價有賴于專項資金核算提供的會計信息，而實施績效評價又能促進專項資金進行規范核算。通過建立專項資金績效評價分析制度，對提高預算編制科學性和合理性，優化資金結構，規范會計核算，提高資金使用效率，強化監督管理都將起到積極的作用。財政部門應通過績效評價機制調動事業單位節約資金的積極性。此外，還要根據項目的不同特點設立不同的評價指標，采用科學的方法對專項資金的使用情況進行評價和獎懲，并將考評結果作為以后年度專項資金審批的依據。
