隨著我國經濟體制改革程度的不斷深入，我國的政府職能正發生著一個較為深刻的改革。為應對此變化，應在對傳統預算支出管理制度的基礎上，建立一個與市場經濟發展相適應的預算支出管理制度，形成一套新的公共支出管理制度。財政國庫集中支付制度是一種現代國庫管理制度，該制度在國外也被稱作為國庫直接支付。采用這種國庫直接支付手段，建立國庫集中支付制度的最終目標在于最大限度的降低財政資金在庫外由于閑置而導致的浪費問題，進一步提高財政資金的使用效益。建立起該支付制度，既加強國庫資金管理效益，還能有效的對財政資金進行控制，進一步扼制腐敗滋生，同時對宏觀經濟的調控起到積極作用，促進公共財政體系的整體構建和不斷完善。
一、當前財政國庫集中支付制度存在的若干問題
(一)預算編制趨于復雜，編制難度加大
在采用國庫集中支付制度之后，財政資金的使用主要是通過財政授權支付以及財政直接支付兩個手段來進行。但是，一些單位，如高校：在實行綜合財務預算以及收支管理的過程中，除按照具體項目的支出之外，其基本支出項目的劃撥與實際的支出并不能完全契合，這就給高校的預算管理工作帶來一定難度。在做好預算編制之后，應該對掛靠在零余額賬戶中的項目進行具體的分類，確定哪些具體的項目是需要采用財政撥款的方式，哪些是采用預算外資金進行支出的。這在一定程度上導致預算的編制工作趨于復雜，降低了資金支付的效率。
(二)同城跨區域單位間工作的開展受到阻滯
主要是由于財政國庫的集中支付制度暫不允許由零余額賬戶往同城跨區域的本單位同級別核算機構中進行資金的劃撥，對同城跨區域單位資金的劃撥工作起到了一定的阻滯作用。例如：由于基建財務的獨立設置，但一個預算單位只能夠設立一個零余額的賬戶，基建撥款及其他預算內的撥款都應在同一個賬號內進行管理，即兩個不同的會計核算體系在同一個銀行賬戶中使用，不但增加了銀行的對賬工作難度，也不利于同城跨區域單位間工作的開展。
(三)資金管理存在漏洞
目前，財政部門根據部門預算將部分資金劃撥到會計集中核算中心在銀行開設的賬戶當中，而一部分資金則直接劃撥至單位或是部門在銀行直接開設的賬戶中，任其自主支配。這種制度使得一部分的國庫資金集中于會計核算中心開設的賬戶中，導致國庫資金分散；而另一部分資金則流入到單位和部門開設的賬戶中，使部門或單位的資金不利于統一管理，諸如超出預算、未列預算支出、虛列支出及變項支出等問題，形成資金管理方面的漏洞和不足。
(四)管理與支付系統的不統一，導致會計核算真實性降低
國庫集中支付系統采用的是收付實現制度對各項支出
進行列支，且各項經費在實際的支付過程中才能夠得到支付令的簽發或是支付申請的辦理工作。但是，對于那些已經發生，但沒有形成支付手段的支出在系統中卻不能夠及時予以反映。如：在材料的購置與管理上，單位通常是先購置再領用，月底按照實際的使用列入到各項目的支出。而采用集中支付的形式后，單位則被要求在購置材料的時候就應該分清渠道。不同項目的材料購置資金渠道應對應，但在實際采購過程中，材料購置涉及的程序較多，采購的數目較大，因此只有在各項目組領用時才能將渠道分開。此外，當月購置的材料如未使用完，尚有部分保存在庫，這些因素將導致支付令簽出時區分資金項目出現困難，難以做到真正分清，出現核算的支出與支付信息不一致的問題，對會計核算的真實性產生一定影響。
二、完善財政國庫集中支付及會計核算的手段與策略
(一)全面推行部門預算制度
部門預算作為公共財政建設支出的基礎，是我國建立市場經濟制度的基本要求，也是實現財政國庫支付的前提條件。采用部門預算之后，一個獨立的部門所有的收入及支出都可在統一的預算中得到體現，確保了預算的統一性與完善性。同時，這種方法還可以有效的控制預算執行過程中的不規范行為，有效的提高預算執行過程的透明度。
從當前的情況來看，部門預算應該對當前的“基數法”預算編制進行改革，積極的推行“零基預算”的預算編制策略。當前采用的“基數法”編制預算時，在進行下一財務年度的預算編制過程中，采用上一財務年度的實際支出數額作為基礎，結合下一財務年度的財政收支情況以及相關影響因素，對不同的支出項目確定一個增、減比例后進行編制。這種方式僅僅是在原基數之上進行單純的累加，沒有按照公平原則進行，導致支出的剛性增加以及預算約束軟化的問題。如采用“零基預算”，則按照正常的經費及實際所需的專項經費對整個預算進行重新編制與核定，其中“正常的經費”則按照人員定額的方式進行，基本做到保留、取舍和增加的合理化。
(二)提高預算單位的配合程度
采用國庫集中支付的手段雖然有效的強化了財政的監督功能，但還應處理好服務與監督的關系，這就要求與預算單位進行良好的配合。而各預算單位應在既有的管理體制下，會計人員通過靈活的選擇賬目理財方式來充分的發揮出他們的主觀能動性。集中支付的制度使得各個部門在思想上形成了一種只見指標不見錢的現象，導致部門在資金使用的思想上存在被動服從問題，不會積極的去采用理財的方式保證資金的充分利用，同時財務會計人員在會計信息的掌握方面也受到一定程度的影響。因此，應建立相應的激勵機制，完全調動各預算單位的領導及會計人員的理財積極性，使得有關人員主動思考如何高效、安全地使用好財政資金，確保支付核算能夠達到預期的目的。
(三)優化業務流程，提高支付效率
在集中支付原則的基礎上，應以方便用款單位為目的，對實際操作流程進行改進
和簡化，對資金的劃撥操作方式進行完善，積極提高資金的支付與劃撥效率。可通過以下方式對國庫資金的集中支付流程進行優化：其一，將預算單位的用款從之前的每月申報和劃撥一次改為每一季度的第一個月的半月前進行整體用款計劃的申報和劃撥，臨時用款計劃則可以隨時申報，且在申報的三個工作日內給予批復；其二，對用款計劃的審批程序進行簡化，尤其是要對財政內部的用款計劃申報流程簡化。例如：對公用經費以及人員的審批程序可直接報送至國庫部門進行審批，或在均衡撥款的原則下，定期如在每月的月底自動生成并下達用款計劃；其三，對資金的清算程序進行簡化和完善，有效的節約資金的清算時間，盡量使單位的用款時間得到延長，便于用款單位對資金的操作。在申報方式方面，應逐步采用網絡申報方式，取消紙質憑證的申報。
(四)做好預算會計改革工作
目前，我國的預算會計主體核算環境已發生很大變化，尤其是政府部門職能轉變和財政體制改革的迫切需要，以及政府部門對會計信息提出的決策、參考要求，使得對現行預算會計進行改革成為當務之急。現在，收付實現制因其無法真實反映經濟業務的發生，已不能滿足部門預算及會計核算的需要。建議將固定資產購建業務納入集中支付制度的會計核算中，對行政、事業單位的固定資產采取計提折舊政策，以真實、準確反映各單位的資產使用和庫存情況。
財政國庫集中支付手段是保證預算管理得以實現的重要途徑和方式，是公共財政理論及財政效益得以實現的重要方式，操作的過程中應及時總結，提出相關的改革意見，供有關部門后續的修改和完善。
