1.創新理念，明確改革總體方向
傳統公共部門會計核算通常以收付實現制為基礎，但由于收付實現制有其自身缺陷，如無法全面準確地記錄和反映負債狀況、不能反映跨年度交易引起的風險、不能有效分析資金運用情況和效果、財務成果易于被操縱等，自20世紀90年代以來，西方一些國家在公共部門會計核算中引入了權責發生制，并逐漸成為主流趨勢。隨著會計標準日趨國際化，我國公共部門引入權責發生制也成為必然。但權責發生制在全面、準確反映當期現金流方面也存在一定的局限，還需收付實現制加以彌補。
由此可見，公立醫院會計制度改革總體方向應為基于修正的權責發生制，引入企業會計制度理念，將具有與企業相同經濟特征的會計業務趨同于企業核算，對具有公立醫院特征的業務單獨規定。這樣不僅有利于政府部門宏觀管理，還能促進公立醫院降低耗費，提高經營管理水平。
2.借鑒經驗、真實反映經濟狀況
目前《醫院會計制度》適用于各級各類公立醫療機構，而大量民營醫院、慈善醫院、外資醫院等采用的是《企業會計制度》。不同的核算體系與方法，造成相互會計信息的不可比，不利于各種所有制醫院之間相互比較分析、不利于相互促進和競爭。
根據醫院會計制度改革總體方向，筆者認為應將具有相同特征的會計業務趨同于企業，提供統一可比的會計信息，以全面真實地反映醫院經濟狀況。可以從以下幾方面著手：（1）對固定資產計提折舊。可參照企業會計制度計提固定資產折舊，并根據實際情況采用平均折舊、加速折舊等方法。鑒于醫療設備幾乎沒有回收價值，且公立醫院對國有資產沒有處置變賣權，變賣收入全部上繳財政，可不予考慮固定資產殘值。（2）將基建會計納入醫院會計統一核算。基建會計一直游離于公立醫院會計核算之外，使部分醫院基建資金不在基建會計賬戶反映，難以全面、完整反映固定資產的形成。為了切實加強依法理財，全面反映醫院經濟狀況，應將基建會計納入醫院會計核算，將與基建相關核算內容補充進去，同時設計相應的基建報表，以滿足醫院內部和主管部門的信息和管理需要。（3）增加無形資產核算。作為一個高技術、無形資產價值突出的行業，無形資產對醫院競爭實力和發展具有重大影響，但會計上對此沒有體現，管理上也未引起足夠重視，造成無形資產流失嚴重。筆者認為應增設“無形資產”科目，如實反應這方面信息，促進對無形資產的認知和管理，防止這種稀缺資源的流失。
3.防范風險，夯實資產價值基礎
醫院資產種類繁多，性質用途各異，根據市場行情購入的各類資產在面臨市場競爭、技術的不斷進步和未來價格波動的情況下存在巨大減值風險。但現行會計制度對此并未予以反應，易使資產價值被高估，違背會計核算的謹慎性原則。對此，筆者建議按照謹慎性原則對醫院的藥品、庫存物資、固定資產等計提減值準備，以合理預計醫院未來損失，防范經營風險，提高公立醫院的競爭實力。
4.準確核算，提升醫院成本管理水平
現行的成本核算方式不能如實反映醫院成本狀況，重要原因之一就是管理費用的分攤。管理費用是醫院行政和后勤部門發生的費用，在醫院業務支出中占較大比重。簡單地按人員比例分配到醫療支出和藥品支出，不僅無法反應經濟實際狀況，還人為扭曲了醫院醫療服務成本和藥品成本，不利于醫院內部控制，也不利于國家對醫院的業績評價和宏觀管理。筆者認為，可借鑒企業核算經驗，不進行管理費用分攤，而直接轉入收支結余。此外，為方便政府宏觀管理和醫療服務項目定價，也為優化醫院內部臨床路徑、加強成本管理，建議根據醫療項目種類與臨床標準路徑采用作業成本法計算分攤各種醫療項目成本、費用，以準確核算醫療項目成本信息。但考慮到作業成本法是完全不同的一種成本核算方法，推行起來難度較大，因此不作為日常會計核算要求，可根據政府和醫院的實際需要予以開展。
5.服務改革，整合完善會計業務
新醫改方案強調公立醫院回歸公益，這一改變必然產生大量公益性支出。這些公益性支出不同于一般經營支出，應予以區分。對此可增加公益性支出科目，集中予以核算和反映，為財政補助提供信息基礎，也區分其他經營性成本費用，以利于醫院分類管理和績效考評。
6.改進報表，滿足各方信息需求
會計報表作為全面、總括地反映醫院在一定時期內財務狀況、經營成果的報告文件，應能滿足財政、審計、衛生主管部門、單位管理層及其他相關方信息需求。對此可按企業會計模式設計醫院會計報表，增加現金流量報表。這樣也便于醫院加強資金規劃和管理，提高資金使用效率。
