在對2008年度的企業所得稅進行匯算清繳時，稅務機關應從以下幾個方面進一步強化所得稅的專業化和精細化管理。
一、抓好匯繳關。認真匯繳審核，尋找所得稅風險管理點。從既服務于企業，又保護稅務干部的角度出發，加大匯繳審核力度，不能完全依托中介機構的代理申報。對發現有明顯問題的，及時深入企業進行核實，盡量把問題消滅在匯繳期內。要嚴格執行匯繳審核機制，組織匯繳審核小組，除認真審核企業填報或中介機構查賬報告披露的有關納稅事項和相關資料，對情況特殊的企業，稅務人員要深入企業幫助核實申報的準確性和真實性。
二、抓好評估關。為進一步發揮評估與審計的作用，要把納稅評估、審計、反避稅工作結合起來。一是將納稅評估的評析資料傳遞到審計環節的分析性復核底稿中加以利用，以減少或避免重復工作。二是將納稅評估的評析資料作為篩選避稅嫌疑戶組成部分。三是對納稅人的申報表和財務報表進行審計評析后發現的異常情況，按性質不同分別按要求處理。
三、抓好管理關。按照企業所得稅分類管理的要求，結合征管力量和收入目標管理，一是要抓住重點行業。在注重強化日常征管的同時，稅務干部要加強對行業核算情況的了解，掌握同行業的主要指標，及時進行橫向分析、比較，以盡早發現稅收管理中的漏洞。二是要抓住重點企業。對轄區內的重點稅源企業，責任區責任人要定期、逐戶上門巡查，從企業的經營常規、行業盈利水平、實際生產能力等方面及時分析，查找存在的問題，提醒企業主動進行申報、調整。三是要抓住重點環節。企業所得稅稅負預警提醒是抓好所得稅管理的重點環節。眾多中小企業是管理的難點，管理人員應充分利用信息化手段，取得相關數據、指標，對指標異常企業進行內部資料的申報審核和分析，對無法找出原因的采取評估約談等方式，或進一步上門核查，提高申報的準確性。
四、強化非居民企業管理。非居民稅收由于稅源分散，流動性強，業務復雜，不易控制，征管難度很大。一是定期到外經貿、外匯管理、海關、銀行等部門走訪，加強溝通協作，了解企業與境外公司簽約以及向境外付匯的情況，掌握稅源，防止漏管。二是嚴格審查，依法征稅。指定專人對扣繳義務人同外國公司簽訂的信貸、技術轉讓、擔保、認證或檢測等合同協議進行審查，對照有關政策文件及境外公司所在國與我國簽訂的雙邊稅收協定計算征稅的金額。另外，對涉及技術轉讓合同的，還要求企業報送其對外簽約情況的書面報告和簽訂合同的副本。三是健全制度，長效管理。對已登記的應稅合同，建立臺賬和底冊，進行跟蹤管理。對重點預提所得稅的扣繳義務人，定期開展培訓，以提高扣繳義務人的扣繳意識。對一些交易金額大、條款含糊的合同啟動國際稅收情報交換程序，向境外公司所在國主管稅務當局請求稅收調查。
