預算執行審計是指各級審計機關依據本級人大審查和批準的年度財政預算，對本級財政及各預算執行部門和單位，在預算執行過程中籌集、分配和使用財政資金的情況以及組織政府預算收支任務完成情況和其他財政收支的真實、合法、效益性所進行的審計監督。從某種意義上講，預算執行審計，實際上也就是審計本級政府。開展同級預算執行審計，已經成為財政預算管理和監督的重要環節，是加強宏觀調控，促進依法理財，規范財政管理，提高公共財政資金使用效益的一項重要措施，也是一項必須堅持的重要法律制度。從審計的對象來看，預算執行審計的對象涉及到本級財政部門及其內設機構、本級地方稅務部門及其直屬分支機構、本級政府直接管理的一級預算單位、本級金庫及下一級財政等有關部門和企事業單位?？v觀預算執行審計的發展歷程，從其各時期審計內容的不同側重點和目標來看，可以將其大致劃分為這么幾個階段：起步階段，以收入預算為審計重點，主要目標是“摸清家底、堵漏補缺”；發展階段，收入預算和支出預算審計并重，主要目標是“查錯糾弊、防微杜漸”；完善階段，以支出預算為審計重點，主要目標是：“綜合監督，促進規范”；提高階段，以財政效益審計為重點，主要目標是“參與決策、提高效益”。
預算執行審計是法律賦予審計機關的基本職能，它在發揮審計監督，促進財政改革和國民經濟健康發展等方面都起到了積極作用。但隨著我國財政體制改革的不斷深入和社會經濟的快速發展，縣級預算執行審計的發展顯得相對滯后和很不平衡，有的地方已經發展到以效益審計為重點的“參與決策”階段了，可一些地方卻還停留在“摸清家底”的起步階段。特別是近幾年來，國家的財政收入快速增長，財政投入的各項建設資金和專項資金的數額越來越多，建設規模越來越大，而審計對這些資金的跟蹤監督卻遠遠跟不上形勢的步伐，審計發揮的作用遠遠達不到社會的期待。因此，對基層審計機關來說，更新觀念，與時俱進地深化預算執行審計的內容，提升審計的層次，顯得越來越迫切。正如李金華審計長所說：“今天的審計已經不再是簡單的查賬，審計環境在變，對象在變，審計的技術和方法也在變，在變化的社會中，面向未來的審計核心戰略應該是讓我們的社會更安全、讓我們的政府更高效”。財政預算執行審計必須適應社會經濟的發展趨勢。財政資金來源于老百姓的稅收，政府在行政過程中正確合理地使用老百姓的稅收，是政府對人民負責的表現，因此，對現階段而言，必須由收入審計向以財政支出為重點的審計轉移，并逐步向效益審計轉變。但是，在一些經濟后發達地區，對預算執行審計工作的認識還沒有達到應有的高度和深度，滿足現狀，不思進取，缺乏創新，預算執行審計工作還存在諸多需要我們認真思考并加以解決的問題：
一、認識模糊，重視不夠，水平不高
首先是對預算執行審計這一工作本身認識模糊，從而把預算執行審計搞成了預算收入審計。《審計法》規定，地方各級審計機關對本級預算執行情況和其他財政收支情況進行審計監督。由此可見，預算執行審計的內容范圍包括本級預算執行情況與其他財政收支情況兩大塊，而每一塊又包含收、支兩個方面的內容。對于“預算”的含義，我們可以很容易地從《預算法》中找到答案：地方各級政府預算由本級各部門（含直屬單位）的預算組成，財政預算包括收入預算和支出預算。由此可見，預算執行也就包括收入預算執行和支出預算執行。毫無疑問，《預算法》規定的財政收入、支出預算的具體項目和內容都是審計機關預算執行審計的內容?！捌渌斦罩А?，是指預算資金以外的所有其他財政性資金的管理使用情況，主要包含預算外資金、政府性基金、國有資產經營收益等。由于認識上的模糊，導致了預算執行審計的偏差，可以說，側重收入的預算執行審計是極不完整的。
其次就是對預算執行審計的對象范圍認識模糊，認為預算執行審計就是對財政、稅務部門及本級金庫的審計。我國《預算法》規定，“中央及地方各級政府預算由政府各部門的預算組成”，“各部門預算由本部門所屬各單位預算組成”。按照《預算法》的要求，各級政府需要編制部門預算和單位預算，也就是說，本級各預算組成部門和單位都是預算執行審計的對象范圍。所以說，預算執行審計涵蓋的對象范圍和內容是非常豐富的，任務是非常繁重的，影響是非常廣泛、深遠的。
再次是對預算執行審計的意義和重要性認識不足。預算執行審計不僅有利于進一步完善預算編制體系及內容，促進預算編制的科學性和合理性，而且有利于強化預算約束力，實現“軟預算”向“剛預算”轉變，促進各預算部門依法理財，提高資金使用效益。再就是有利于人大有針對性地履行監督職責，人大作為我國的立法機構，有權利也有義務對政府各部門預算執行情況進行監督，但由于受人員力量、專業知識等方面的限制，人大要對本級預算執行情況進行全面的監督，就需要通過審計部門對本級預算執行的審計，來掌握預算的執行情況，從而履行監督預算執行情況的職責。
由于認識的模糊，直接導致了對預算執行審計工作的重視不夠，從而缺乏對這一工作的深入調研和部署。特別是基層審計機關，對財政、稅務部門的政策調整、運作方式等情況缺乏必要的跟蹤了解和信息溝通，也沒有安排專人對相關信息資料進行收集、整理、研究、分析。審前準備工作的嚴重不足，以致對預算執行審計工作的規劃和項目的安排等產生了偏離實際、脫離重點等不利影響。一些人認為，財政預算執行審計年年搞，而且每年的審計對象和內容基本都類同，而預算是由政府制定、人大批準、財政部門執行的，預算執行和其他財政收支體現的是政府的意志，審計部門隸屬政府，預算執行審計是下級監督上級，雖然“理直”，但無法“氣壯”，揭露問題是給政府領導的臉上抹黑，會影響政府的形象。因而對預算執行審計的觀念逐步淡化，信心動搖，流露出應付的心態，從而對預算執行審計缺乏應有的積極性和主動性。再加級審計機關在人事安排上經常輪換崗位，也使得當年的審計與以前的審計相脫節，從而對被審計單位違紀問題的構成、程度、手段等情況缺乏統一規范的記錄，致使許多情況難以從整體上分析。在具體的實施過程中，為了按時完成任務，審計人員也不愿“自找麻煩”去做更深入的工作，而是例行公事般的被動應對，按照往年的做法，依葫蘆畫瓢。每年都這樣消極應對，倉促上馬，草草收場，致使預算執行審計幾十年沒有長進和突破，長期停留在起步階段的水平上。
二、思路不清，目標不明，監督不力
本級預算執行審計的目標是什么、重點在那里，應該發揮怎樣的作用，在一些地方，特別是基層審計機關還不是很清楚。因此，造成基層審計機關機械地參照上級的方案執行，有的則延續財務收支審計的路子，把重點放在財政、地稅部門本身的違規問題上，導致“同級審”失去應有的作用。
從現在縣級預算執行審計的內容和重點看，目前主要還是對財政財務收支的真實性和合法性開展審計，審計內容單一，沒有確立與社會經濟發展同步的明確目標，適應現代財政管理理念的績效審計還沒有起步，從一定程度上影響了審計的效果。從審計對象看，審計部門只注重對財政部門、地稅部門的審計，而對建設項目、專項資金、用款單位等跟蹤延伸審計不多，對財政資金的使用效果和效益問題基本上沒有涉及。
審計機關作為政府的一個職能部門，反過來要監督政府自身，本來就存在極大的局限性，再加上本級預執行審計中發現的地方財政行為的不規范性和違紀問題，均與本級政府的財政意志、政府行為、財政利益密切關系；同時，為了穩定部門利益，照顧人情關系，各利害部門甚至政府都會出面要求審計監督不要過嚴，結果造成預算執行審計監督不力，流于形式。曝光、處理的大多是一些既無關地方財政利益，又無關違規制約的問題。最后形成的文書是委婉、柔和的，送到人大手中的工作報告，經過層層篩選，避重就輕，使得人大根本無從掌握完整、真實的情況，無法對政府進行有效監督。
