推行金稅工程是加強增值稅管理，保障國家稅收，防范和嚴厲打擊各種偷、騙增值稅等違法犯罪活動的重要手段，是國家實現稅收信息化管理的重要組成部分。特別是金稅工程二期的拓展與完善，有效遏制了“假票抵扣”、“真票虛開”等增值稅專用發票犯罪活動。目前金稅工程運行質量不斷提高，但是，金稅工程稽核系統中增值稅專用發票存在大量的存根聯滯留，并且多數是非正常滯留存根聯信息，事實證明多與賬外經營有關，必須引起我們各級國稅機關足夠重視。我們要拓展管理思路，積極采取應對措施，加強金稅工程存根聯滯留發票管理，嚴厲打擊賬外經營，不斷提升增值稅管理質量和效率。
一、存根聯滯留發票的形成
由于金稅工程稽核系統發票存根聯數據與認證系統發票抵扣聯之間的比對，不能夠完全一一對應，在稽核系統中長期滯留著大量得不到認證系統抵扣聯數據比對的存根聯數據，這樣就形成了存根聯滯留發票。通俗些說，存根聯滯留發票就是指金稅工程系統中缺少抵扣聯的專用發票。
存根聯滯留發票形成的原因是多方面的。一是按照政策規定不允許抵扣進項稅額。根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》第十條規定，納稅人取得的六種情況下的購進貨物的進項稅不允許抵扣，如最常見的購進固定資產不允許抵扣進項稅額，沒有通過認證系統認證，形成了滯留票。二是發生退貨或銷售折讓銷貨方開具紅字專用發票。購貨方將抵扣聯、存根聯退還給銷貨方，而銷貨方已將記帳聯作帳務處理，同時開具了相同內容的紅字專用發票。在這種情形下，銷貨方已報稅，抵扣聯已退回銷貨方，也形成滯留票。三是納稅人主動不抵扣進項發票，形成滯留票。調查發現，部分企業為了少繳稅，經常采取銷售商品不記賬的方式隱匿銷售收入，而如果將進項稅額全部抵扣，會出現零負低申報，就可能被各級稅源管理部門列為重點評估對象；還有，如果將購進貨物全部入帳，而銷售不記賬，帳面上存貨等科目余額將非常大，必然為稅務人員留下查賬的線索。因此，企業采取“體外循環”，也就是帳外經營，將銷售時不需開具增值稅專用發票的購銷業務，均不進行核算或另設一套帳核算，主動放棄一部分進項稅抵扣權達到偷稅的目的。除以上三個方面的主要原因外，還有由于某些客觀因素造成抵扣聯超過90日認證期限未認證，納稅人在已取消一般納稅人資格或停止抵扣進項稅額期間取得專用發票等情況，也會形成滯留票。
但事實上，大部分稽核系統滯留的發票存根聯數據是有問題的，相當多存根聯滯留發票的背后都與賬外經營有關。根據導致存根聯發票滯留的原因是否與賬外經營有關，我們將存根聯滯留票分為正常滯留和非正常滯留兩類。政策規定不允許抵扣的抵扣聯對應的滯留存根聯，以及紅字發票對應的滯留存根聯，為正常滯留票。納稅人主動放棄抵扣聯認證進行賬外經營形成的滯留存根聯，為非正常滯留票。在目前防偽稅控系統覆蓋所有增值稅一般納稅人，稽核、協查系統高效運行的情況下，與通過“假票抵扣”、“真票虛開”多抵扣稅款的偷稅手段相比，主動放棄進項發票抵扣權的新的偷稅方式，更具有隱蔽性，更容易造成稅款流失。
二、加強金稅工程存根聯滯留發票管理的建議
針對以上問題，筆者建議應從以下幾方面著手加強金稅工程存根聯滯留發票管理：
（一）對存根聯滯留發票開展專項評估。要加大存根聯滯留發票的比對頻度，通過稽查手段對滯留金額大、主動放棄進項稅額抵扣可能性較大的企業如商貿企業進行核查，落實形成滯留的具體原因；對滯留金額相對較小的企業，通過納稅評估和稅源監控手段，落實形成滯留的具體原因；加強對企業進項稅額的監控，防止納稅人通過其他方式隱瞞進項和銷項稅額。
（二）建立遏制納稅人采取主動放棄抵扣權方式偷稅的長效機制。省級國稅機關應建立相關制度，通過金稅工程系統分地市每月及時向下傳遞存根聯滯留信息，市縣級國稅機關應全面掌握納稅人的購進信息，對有連續三個月存根聯滯留問題的企業進行重點核實，督促企業按規定認證、抵扣進項專用發票，實現上游企業對下游企業的逆向制約，即雙向以票控稅，堵塞企業為平衡稅負而人為不抵扣專用發票的問題。還要建立滯留票分析、核查的長效機制，制定存根聯滯留票核查管理辦法，確定負責核查的具體單位和部門，明確核查的工作流程及方法。
（三）強化對一般納稅人專用發票開具的監管，進一步夯實增值稅基礎管理。防偽稅控系統制止了“假票抵扣”，稽核系統遏制了“真票虛開”。隨著滯留票分析核查機制的建立，納稅人偷稅的方式可能逐漸向不開具增值稅專用發票和不按規定開具紅字專用發票方式轉變。而增值稅管理系統中存儲的專用發票等數據，詳細記錄了一般納稅人的主要經營活動，通過對這些數據的分析利用，可以從進項、銷項、滯留等多個方面實現對納稅人的監控。因此，要在政策上規定，一般納稅人銷售貨物、應稅勞務時，除按規定不得開具或可以不開具專用發票的情況外，必須向購買方開具專用發票。開具紅字發票，必須嚴格按照有關規定執行，必須有退貨或銷售折讓的行為發生。各級稅務機關要加大對不按規定范圍、時限開具專用發票（包括紅字發票）的處罰力度，從源頭上堵塞稅收流失的漏洞。
