中國中醫研究院是國家中醫藥管理局直屬的集科研、醫療、教學為一體的綜合性研究機構，屬社會公益型事業單位，下設中藥研究所、針灸研究所、骨傷科研究所、基礎理論研究所、信息情報所及醫史文獻研究所等科研機構。目前中醫研究院承擔著“973”國家重點基礎研究發展規劃項目、國家攀登計劃項目、“863”計劃項目、科技三項費用項目及部門行業科技項目，其中國家級課題75項、省部級課題 116項、院級課題 86項，總預算金額達8300多萬元。因此，加強財務核算管理尤其必要。對于中醫藥科研院所來說，這種管理方法主要是指內部課題成本核算。
一、科研項目與經費管理的現狀
改革開放以來，特別是1987年建立《科研單位會計制度》以后，科研項目管理曾根據科研經費來源，采取了不同的管理模式及核算方法。隨著社會主義市場經濟的建立和發展，1998年科研單位又實行新的會計制度與財務制度。科研經費的撥款途徑發生變化，改變了原來全部經費由主管部門撥付的作法，實施課題招標，平等競爭。科研．院所的經費來源包括正常經費、專項經費、中標課題經費、合作研究經費等，出現了全額預算、差額預算、自收自支、專項核算等不同的撥款經營形式。隨著科研項目、科研課題而發生的經濟活動打破了舊的會計管理模式，促使中醫研究院開始實行“科研課題組長負責制”，財務會計核算則采取相應的方法與措施。主要包括：（l）課題經費支出由課題組長負責；（2）使用內部支票，專供院所內各部門之間的課題費用結算；（3）設計項目核算科目，利用電算化優勢，高效快捷地完成課題項目核算，按月提供課題經費的收、支、余結算情況，承擔課題明細賬查詢服務；（4）堅持對科研項目、課題經費的動態管理；（5）對科研項目、課題涉及的院外協作和設備購置實行宏觀管理。這一管理模式適應了當時計劃經濟向社會主義市場經濟轉軌的要求，體現了經濟核算中物質利益原則，相對提高了科研人員的積極性，促進了科研工作的發展。但在實踐中還有在一些問題，一部分科研人員對于投入產出。成本核算仍然認識模糊。
二、實行內部課題成本核算的意見
1．實行內部課題成本核算的基本條件必須完善，基礎核算資料應真實、全面。
（l）實驗室是科研活動的基本場所，是成本核算的基礎。健全實驗室的管理制度，科研項目開題進入實驗室，結題退出實驗室時，須清查盤點實驗室配備的器材、物料存量，折算其價值，作為區分不同課題成本的界限。
（2）建立儀器管理室，使大型儀器設備集中管理，專管共用。這既能提高儀器設備使用率，又能保證定期保養維修，節約資金，降低成本，同時保證開機記錄完整、準確。
（3）配備課題成本核算員，記錄參加課題人員工時、實驗室占用工時、儀器使用工時等需要核算的項目，要求全面、真實、及時，避免隨意性。
2．合理確定費用攤銷的依據。
（l）科研用水電費的攤銷，可根據工時與占用實驗室面積計算攤銷比例。
（2）設備使用費可根據設備折舊費、維修費，折合開機工時計算。
（3）人員費用可根據參加課題人員及工資標準計算，交叉使用的人員，可按工時折合。
（4）后勤保障工作，實行物業管理，合理計算。
（5）管理費的攤銷可根據工時計算。
實行內部課題成本核算，是一項系統工程，需要建立各方面的配套措施，才能很好地發揮作用。
